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wwling

铜虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】大家帮忙看看沉积物DNA提取中碰到的问题

最近对沉积物DNA提取了两次,效果不好。发现每次裂解、水浴、离心后,上清是淡黄色的,但是加酚氯仿抽提时,一加进去上清就变红棕色了,乙醇沉淀后(过夜)有的管子红棕色物质沉到管底了,有的离心后也没有沉下来(12000rpm,10min),倾倒乙醇的时候管底的红棕色物质也容易倒出去。想问问大家,有没有人知道那红棕色的是什么东西呢?然后有没有好的提沉积物DNA的方法啊,我用的方法提过一些土壤没大问题的,但是提这个沉积物就麻烦了,请有思想的各位给帮帮忙,愿我有个好年过
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zbq-92


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我们以前提根际土的时候也有类似的现象,DNA时提出来了,就是有颜色,有些地区的土有,有的没有。后来师姐配了个脱腐液,对样品先进行预处理,然后就好多了。
4楼2010-01-23 17:00:28
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
什么沉积物?水下底泥沉积物吗?据说提泥的DNA,腐植酸影响很大。
2楼2010-01-23 15:04:40
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wwling

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-23 15:04:
什么沉积物?水下底泥沉积物吗?据说提泥的DNA,腐植酸影响很大。

谢谢关注
恩 是的 湖水底泥
土壤的提取还好啊 怎么底泥就提不出来呢
我提了7个深度的底泥  结果就只有两个提出来了
3楼2010-01-23 15:18:13
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