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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】大家帮忙看看沉积物DNA提取中碰到的问题
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wwling

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】大家帮忙看看沉积物DNA提取中碰到的问题

最近对沉积物DNA提取了两次，效果不好。发现每次裂解、水浴、离心后，上清是淡黄色的，但是加酚氯仿抽提时，一加进去上清就变红棕色了，乙醇沉淀后（过夜）有的管子红棕色物质沉到管底了，有的离心后也没有沉下来（12000rpm，10min)，倾倒乙醇的时候管底的红棕色物质也容易倒出去。想问问大家，有没有人知道那红棕色的是什么东西呢？然后有没有好的提沉积物DNA的方法啊，我用的方法提过一些土壤没大问题的，但是提这个沉积物就麻烦了，请有思想的各位给帮帮忙，愿我有个好年过
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1楼 2010-01-23 13:45:08
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wwling

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-23 15:04:
什么沉积物？水下底泥沉积物吗？据说提泥的DNA，腐植酸影响很大。

谢谢关注
恩 是的 湖水底泥
土壤的提取还好啊 怎么底泥就提不出来呢
我提了7个深度的底泥  结果就只有两个提出来了
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3楼2010-01-23 15:18:13
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
什么沉积物？水下底泥沉积物吗？据说提泥的DNA，腐植酸影响很大。
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2楼2010-01-23 15:04:40
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zbq-92

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我们以前提根际土的时候也有类似的现象，DNA时提出来了，就是有颜色，有些地区的土有，有的没有。后来师姐配了个脱腐液，对样品先进行预处理，然后就好多了。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-01-23 17:00:28
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