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【求助】对接过程中的氢键和计算的问题
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对接过程中氢键和结合能量是变化的吗? 同源建模得到一个受体的蛋白,去对接一个新发现的配体, 怎么样去准确度量对接的氢键的长度和结合的自由能? 到底是取平均还是取稳定值? 疏水相互作用又该怎样准确的度量? |
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