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【求助】docking时出错
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我刚接触CADD,有几个问题想向大家请教一下。 开始做docking时,score的值很不好,一次对接了二十几个化合物,但是score的值 最大只有零点几。后来先用FieldTemplate和FieldAlign两个软件处理了一下,发现 score的值好了很多。我这样做,会不会影响对接的结果那? 还有一个问题,用FieldTemplate时,选择不同的化合物做模板,然后用FieldAlign处 理,再做对接时得到的结果不一样。用FieldAlign做计算时用的是同一批化合物 (也 就是说输入的构象不同,输出的结果也不同。现在做的对接是柔性对接,我认为对 构象的要求应该不高。因为对接的时候会进行构象优化。但实际上会出现很大的问 题。)这是为什么呀?麻烦各位指点一下。 收藏 分享 评分 |
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