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gn2003_0

金虫 (小有名气)

[交流] 【分享】基因组DNA质量检测

一、        技术方法
对于基因组DNA质量检测主要包括:基因组DNA片段大小的确定,基因组DNA浓度的测定,基因组DNA纯度的测定三方面。
用到的技术方法有:琼脂糖凝胶电泳,使用紫外分光光度计测定基因组DNA溶液的OD值
二、        试剂
琼脂糖
溴化乙锭(终浓度0.5μg/ml)
6×上样缓冲溶液
λDNA溶液(50ng/μl)
三、        仪器
电泳仪
凝胶成像仪
紫外分光光度计
四、        操作流程
1. 琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA片段的大小
制作浓度为0.5%(w/v)的琼脂糖胶。
依次取1μl、2μl DNA溶液,混合6×上样缓冲溶液均匀,上样。
同时点λDNA溶液1μl或2μl作为Marker。
1-2V/cm电泳约12-16h。
2. 使用紫外分光光度计测定基因组DNA溶液的OD值
对DNA溶液样品进行稀释,一般稀释百倍。
取DNA稀释液测定OD260与OD280。
按1 OD260=50ng/μl计算基因组DNA原液的浓度,即50×OD260 ×稀释倍数。
计算OD260/OD280值。
五、        注意事项
1.λDNA约48kb,用来指示所提DNA的大小。一般要求所提DNA大小在50kb以上。
2. DNA的纯制品的OD260/OD280值为1.8,而RNA的纯制品的OD260/OD280值为2.0。若OD260/OD280值高于1.8,那么说样品中可能有RNA的污染;若样品中蛋白或酚的污染较严重则OD260/OD280值低于上述两个值。
3.用紫外分光光度计测量OD值时,应控制读数在0.01-2之间,即DNA的稀释倍数要适当。
4. 紫外分光光度计法适应浓度较高并且较纯的样品的定量。核酸在260nm处的吸收非常强,只有存在高水平蛋白污染的情况下才会引起260nm、280nm两个波长下吸光度比值的大幅度改变。因此如果A260/A280值低于1.8,那么就不能通过此法对DNA样品进行精确定量。
参考文献
1.[美]J.萨姆布鲁克,D.W.拉塞尔著,黄培堂等译.分子克隆实验指南(第三版).北京:科学出版社,2002.8.
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gn2003_0

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-16 12:36:


you said "OD值", not"OD260/OD280值", so 0.2-0.8

i am sorry
7楼2010-01-16 21:01:49
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0): 1-15 19:53
1949stone(金币+0,VIP+0):要看片段大小 1-16 13:00
0.5%的琼脂糖胶检测DNA,会不会太小啊,一般不都是0.7-0.8%吗?有没有弄错啊

还有紫外分光光度计的读数应该控制在0.2-0.8之间最好,稍微差一些也没问题,但是0.01-2肯定有问题,我确定,范围太大
2楼2010-01-15 17:04:26
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gn2003_0

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gn2003_0 at 2010-1-15 16:41:
一、        技术方法
对于基因组DNA质量检测主要包括:基因组DNA片段大小的确定,基因组DNA浓度的测定,基因组DNA纯度的测定三方面。
用到的技术方法有:琼脂糖凝胶电泳,使用紫外分光光度计测定基因组DNA溶液的OD值
...

0.5%琼脂糖检测确实有点小。但是也是根据你提取DNA大小而言的。
紫外分光范围确实说大了,但是DNA的纯制品的OD260/OD280值为1.8!!
3楼2010-01-15 17:11:00
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jasco

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1,VIP+0): 1-16 13:00
电泳12-16小时,FT
楼主copy过来都没有仔细看看,哎

[ Last edited by jasco on 2010-1-15 at 17:58 ]
4楼2010-01-15 17:56:23
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