应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【分享】重发一个Amber9,求个Amber10
71/1返回列表
查看: 952  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【奖励】 本帖被评价4次，作者克罗米虎增加金币 4 个
当前主题已经存档。

克罗米虎

金虫 (小有名气)

[资源] 【分享】重发一个Amber9,求个Amber10

如题
TGZ格式:
http://d.namipan.com/d/AMBER9.TG ... ef23ade8f7d11cc3e05
RPM格式:
http://d.namipan.com/d/Amber9.rp ... 42df9c04f4dc703da05
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-01-14 20:38:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

janetfull

金虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

沙发吗？十分感谢，下载了先看看
赞一下 回复此楼
2楼2010-01-19 09:33:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

克罗米虎

金虫 (小有名气)
这么多天终于有人沙发了~感动~
赞一下 回复此楼
3楼2010-01-19 12:15:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuai1934

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

呵呵
回复此楼
4楼2010-01-28 19:38:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢你了。请问怎么安装
赞一下 回复此楼
5楼2010-01-29 14:29:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

克罗米虎

金虫 (小有名气)

不同系统装法有细微区别

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-03-18 12:04
ubuntu AMBER 9安装

1．安装第一步

(1)把AMBER9.TGZ文件拷贝到/usr/local/

#cp–rf /media/AMBER9/AMBER.TGZ /usr/local/

(2)把AMBER9解压到/usr/local/amber9

#tar –zxvf AMBER9.TGZ  

2．打上bugfix.all补丁

到http://amber.scripps.edu下载

(1)把bugfix.all拷贝到/usr/local/amber9目录下面

#cp–rf bugfix.all /usr/local/amber9

(2)
cd  /usr/local/amber9
patch -p0 -N -r patch-rejects
3．安装INTEL编译器intel fortran和intel c++

从以下地址下载
https://registrationcenter.intel ... aspx?productid=1308
https://registrationcenter.intel ... aspx?productid=1322

记住序列号
解压文件并执行

#./install.sh ；按说明一步一步安装，默认安装在/opt/intel

将libstdc++.so.5拷贝到/usr/lib/


4．设置编译器环境
sudo chmod -R 777 /etc/profile
sudo gedit /etc/profile

加入并保存以下三行
export AMBERHOME="/usr/local/amber"
source /opt/intel/对应版本号的目录/bin/ifortvars.sh ia32
source /opt/intel/对应版本号的目录/bin/iccvars.sh ia32

保存并重启系统

5．进入AMBERHOME/src

#cd $AMBERHOME/src

#./configure ifort_ia32

#make serial

6．测试基本的AMBER

#cd$AMBERHOME/test

make test
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-01-30 00:50:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

盈盈一水间

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习了~~~
回复此楼
7楼2010-03-18 10:03:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 克罗米虎 的主题更新
71/1返回列表
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭