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87328068

新虫 (小有名气)

[交流] 多蛋白复合体做X射线晶体衍射,敬请不吝赐教!

假设蛋白A能与蛋白B在体外(In Vitro)相互作用形成2A4B的四级结构(即该结构由两个A与四个B组成)。A、B均为已知蛋白(假设分子量分别为10 kD、20 kD)。Pull-down后非变性凝胶电泳、SDS-PAGE显示蛋白A、B确实能相互结合形成复合物,但我如何才能证实复合物结构组成就是2A4B?我想做X射线晶体衍射测定复合物的空间结构,象这种多蛋白复合体做X-ray现实吗?可以的话具体如何做?敬请不吝赐教!
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87328068

新虫 (小有名气)

再请教!

如果用于X射线晶体衍射的蛋白质样品中除复合体2A4B外,还有少量的A、B蛋白单分子,这样对结果会有什么影响?用于X射线晶体衍射的蛋白质样品是否要求非常纯?是否可用HPLC去掉少量的A、B蛋白单分子?
3楼2010-01-10 18:38:00
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
huangxc8687(金币+1,VIP+0):谢谢参与! 1-10 13:06
87328068(金币+8,VIP+0):谢谢你的回复!我要写个项目申请,其中就有X射线晶体衍射实验方案,我以前从没做过,你看这么写行吗?衷心感谢!①采用悬滴汽相扩散法培养晶体:将1 μl蛋白溶液(之前15000 rpm高速离心30 min,尽可能去除样品中的杂质,减少不必要的成核中心)和1 μl池液在硅化过的盖玻片上混合,倒扣于预先加入200 μl池液的晶体生长板的小孔上,小孔和盖玻片之间用真空脂密封,一定温度下静置;②初始结晶条件摸索采用Hampton Research公司生产的Crystallization Screening KitI和KitII结晶试剂盒,经过对温度、溶液pH、蛋白质浓度、离子强度、添加剂和沉淀剂等条件进一步优化,确定最佳结晶条件;③待晶体长出后,进行X射线衍射分析,晶体衍射数据用Mar-Research面探测器系统收集。数据收集在100 K低温冷冻条件下进行,防冻液为含有15%甘油的池液。数据收集前晶体在防冻液中浸泡5-10 s,然后迅速移到100 K的氮气流中,应用Oxford Cryosystem维持100 K的低温条件。衍射数据通过HKL2000程序包的Denzo/Scalepack程序进行处理;④解析结构(相位确定、电子密度图的解释和结构修正)。 1-10 17:03
应该没有问题,当前pdb蛋白库中有许多这样的结构。
北京人
2楼2010-01-10 12:15:14
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