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lyfxie8607

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】用DS做同源模建后的工作有哪些?

1.用DS做完了同源模建,再进行哪些工作能提高工作的水平(就是能发个好文章)?
2.同源模建后的评分要看哪些指标呢?只看一下拉式图就行了吗?
我用DS中的verify 3D进行了打分,得分是151,软件给出的最高分是169,最低分是76。这样的结果能接受吗?
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fiend_wing_bo

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-14 16:27
还可以看一下ramachandran plot
努力,拼搏
7楼2010-03-09 21:33:27
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 1-10 20:18
1。作些生物试验,验证你搭的模型合理性,比如两个蛋白结合部位的氨基酸突变。。。
2。verify3D就可以,但是主要还是用生物试验来验证。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
2楼2010-01-10 07:32:39
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arthurii

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 1-10 20:18
模型最好跑一下动力学,看到很多DS文献上的同源建模之后都要跑动力学的
3楼2010-01-10 12:12:06
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syfnet

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
跑动力学后变化比较大,拿模板蛋白跑也有很大变化。那么动力学还可信吗?
4楼2010-01-11 19:51:27
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