| 查看: 1391 | 回复: 3 | |||||
| 当前主题已经存档。 | |||||
liujodan木虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】关于Gaussian 中固定原子坐标，键长，的相关问题。
|
||||
|
各位大侠，小弟现在又有一个简单的问题想问了。主要是关于在模型结构优化的时候固定原子的问题。 小弟通过学习，知道想固定原子有这么几种方法。但是问题出现了。具体如下： 方法1. 通过Gaussview 中的atom list editor 快捷按钮 的Freeze 数据设置为-1 来完成。 方法2. 同样通过Gaussview中的 redundant coordinate editor 来设置，比如我要固定原子坐标，可以选择 Coordinate 中的Cartesian coordinate 和 Freeze coordinate。 方法3. 将gjf文件的输入方式，改成Cartesian方式，将原子前边的0改写成-1. (方法3估计有点问题，我没有亲自使用过)。 我的问题出来： 1. 通过方法1，2，我想我们应该能得到想要的、固定某些原子 的输入模型。但是这两种方法是相同的吗？都是将原子的坐标固定吗？ 如果你的回答是“是” 那么请问： 通过方法1的修改，我再去从产看redundant coordinate editor 中的设置时，为什么没有修改的数据？按道理来说，他们是相互连通的，为什么这里没有显示？ 2. 通过方法1.我经常是当设置好Freeze的数据时，保存模型gjf文件，当我再次用gv打开文件的时候，发现atom list editor 中Freeze的选项中，原来为-1的原子，现在不是-1 又变成了原来的0。这是怎么回事？ 谢谢大家的帮助，小弟感激不尽~ 感谢小木中这个科研平台~ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 计算 | 量化计算有意义的讨论 |
» 猜你喜欢
材料/化学相关专业2026级学术/专业型硕士研究生
已经有19人回复
-
求催化作用基础第三版 （甄开吉) 课件
已经有3人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有170人回复
-
26年材料/化学相关专业博士研究生招生 温州大学化学与材料工程学院(26年秋季入学)
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
304求调剂
已经有3人回复
-
上海华东理工大学机械与动力工程学院先进材料与制造研究组招聘公告
已经有0人回复
-
山西大学资源与环境工程研究所化工分离/环境功能材料小组招收2026年博士生
已经有2人回复
-
304求调剂
已经有3人回复
zpppanda111
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 6651
- 红花: 2
- 帖子: 236
- 在线: 613.4小时
- 虫号: 366447
- 注册: 2007-05-09
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
2楼2010-01-06 20:06:31
3楼2010-01-06 21:22:34
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
4楼2010-01-06 21:31:13
