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liujodan木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】关于Gaussian 中固定原子坐标,键长,的相关问题。
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各位大侠,小弟现在又有一个简单的问题想问了。主要是关于在模型结构优化的时候固定原子的问题。 小弟通过学习,知道想固定原子有这么几种方法。但是问题出现了。具体如下: 方法1. 通过Gaussview 中的atom list editor 快捷按钮 的Freeze 数据设置为-1 来完成。 方法2. 同样通过Gaussview中的 redundant coordinate editor 来设置,比如我要固定原子坐标,可以选择 Coordinate 中的Cartesian coordinate 和 Freeze coordinate。 方法3. 将gjf文件的输入方式,改成Cartesian方式,将原子前边的0改写成-1. (方法3估计有点问题,我没有亲自使用过)。 我的问题出来: 1. 通过方法1,2,我想我们应该能得到想要的、固定某些原子 的输入模型。但是这两种方法是相同的吗?都是将原子的坐标固定吗? 如果你的回答是“是” 那么请问: 通过方法1的修改,我再去从产看redundant coordinate editor 中的设置时,为什么没有修改的数据?按道理来说,他们是相互连通的,为什么这里没有显示? 2. 通过方法1.我经常是当设置好Freeze的数据时,保存模型gjf文件,当我再次用gv打开文件的时候,发现atom list editor 中Freeze的选项中,原来为-1的原子,现在不是-1 又变成了原来的0。这是怎么回事? 谢谢大家的帮助,小弟感激不尽~ 感谢小木中这个科研平台~ |
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