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liujodan

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】关于Gaussian 中固定原子坐标，键长，的相关问题。

各位大侠，小弟现在又有一个简单的问题想问了。主要是关于在模型结构优化的时候固定原子的问题。
小弟通过学习，知道想固定原子有这么几种方法。但是问题出现了。具体如下：
方法1. 通过Gaussview 中的atom list editor 快捷按钮的Freeze 数据设置为-1 来完成。
方法2. 同样通过Gaussview中的 redundant coordinate editor 来设置，比如我要固定原子坐标，可以选择 Coordinate 中的Cartesian coordinate 和 Freeze coordinate。
方法3. 将gjf文件的输入方式，改成Cartesian方式，将原子前边的0改写成-1.
(方法3估计有点问题，我没有亲自使用过)。

我的问题出来：
1. 通过方法1，2，我想我们应该能得到想要的、固定某些原子的输入模型。但是这两种方法是相同的吗？都是将原子的坐标固定吗？
如果你的回答是“是” 那么请问：通过方法1的修改，我再去从产看redundant coordinate editor 中的设置时，为什么没有修改的数据？按道理来说，他们是相互连通的，为什么这里没有显示？
2. 通过方法1.我经常是当设置好Freeze的数据时，保存模型gjf文件，当我再次用gv打开文件的时候，发现atom list editor 中Freeze的选项中，原来为-1的原子，现在不是-1 又变成了原来的0。这是怎么回事？

谢谢大家的帮助，小弟感激不尽~ 感谢小木中这个科研平台~

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