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【求助/交流】如何确定起始密码子ATG
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各位虫友,你们好,我想知道如何确定我克隆的序列是否包含完整的编码区,因为做了很久5‘,总是做不出来,但偶然间发现我现已有的序列拼接起来已经可以找到一个较长的ORF,翻译成蛋白质后在NCBI上BLAST,发现和其他物种的该蛋白序列相比对后,其起始比对位置在1,2,3,10.....等位置,把该核苷酸序列进行比对,发现和其他物种的起始密码子已经对上,且ATG之前还空有19个核苷酸。 但是,今天发现一个问题,就是那19个核苷酸的后18个也可以翻译成氨基酸。那么,请问,我的ATG到底是不是起始密码子吗? |
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