24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 1532  |  回复: 4
当前主题已经存档。

qianggene

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何确定起始密码子ATG

各位虫友,你们好,我想知道如何确定我克隆的序列是否包含完整的编码区,因为做了很久5‘,总是做不出来,但偶然间发现我现已有的序列拼接起来已经可以找到一个较长的ORF,翻译成蛋白质后在NCBI上BLAST,发现和其他物种的该蛋白序列相比对后,其起始比对位置在1,2,3,10.....等位置,把该核苷酸序列进行比对,发现和其他物种的起始密码子已经对上,且ATG之前还空有19个核苷酸。
但是,今天发现一个问题,就是那19个核苷酸的后18个也可以翻译成氨基酸。那么,请问,我的ATG到底是不是起始密码子吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

695

木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可以对比起同源物种或者几个物种的同基因,进行确定,我就是这么办的
2楼2010-01-03 19:51:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ATG之前还空有19个氨基酸是什么意思?
3楼2010-01-04 09:19:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

runxiaoli

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我觉得软件寻找ATG的原则应该就是从该序列的第一个起始密码子进行翻译的。我查看了一下我的基因,ATG 前面是不能翻译成起始密码子的,你要不也多下载几个同源基因全长,看这些基因起始密码子前面的序列是否能翻译成氨基酸,如果能的话,也许你 就是扩到全长了,如果不能翻译,也许前面还有需要扩的序列,个人拙见,希望可爱的楼主能有所收获。。。。嘻嘻。
4楼2010-01-04 10:43:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qianggene

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-4 09:19:
ATG之前还空有19个氨基酸是什么意思?

就是我现有的序列中,在我认为的起始密码子之前的5‘-UTR也能翻译成氨基酸,不是19个氨基酸,是19个核苷酸,这其中的18个可以翻译成氨基酸。
5楼2010-01-04 13:13:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qianggene 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 366求调剂 +10 不知名的小卅 2026-04-11 10/500 2026-04-14 11:36 by lifeisbrave
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 求调剂 +8 小聂爱学习 2026-04-11 11/550 2026-04-14 09:23 by 1587964
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +9 xu@841019 2026-04-11 10/500 2026-04-14 08:48 by 木木mumu~
[考研] 机械还有还有名额吗?太难了 +8 笑笑袁 2026-04-10 8/400 2026-04-14 08:44 by screening
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 求调剂 +16 张番茄不炒蛋 2026-04-10 17/850 2026-04-12 13:58 by 熬夜成!
[考研] 277 数一104,学硕,求调剂 +21 瓶子PZ 2026-04-09 23/1150 2026-04-11 23:12 by labixiaoqiao
[考研] 一志愿厦大0856,306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 085400 328分 求调剂 +10 喂你一个大橙子 2026-04-09 14/700 2026-04-11 19:53 by lqspecial
[考研] 085501机械专硕 302分 不挑专业求调剂 +7 汪某. 2026-04-09 7/350 2026-04-11 14:37 by luhong1990
[考研] 275求调剂 +9 1624447980 2026-04-08 10/500 2026-04-11 10:20 by Delta2012
[考研] 22408 327分求调剂 +4 韵风kon 2026-04-10 4/200 2026-04-11 09:51 by 猪会飞
[考研] 调剂 +12 卷卷卷心菜_ 2026-04-09 13/650 2026-04-10 22:36 by Ftglcn90
[考研] 一志愿中南大学物理学,英一66,求调剂 +4 长烟旖旎 2026-04-08 5/250 2026-04-10 10:31 by 颖果儿
[考研] 278求调剂 +27 范婷娜 2026-04-07 31/1550 2026-04-09 20:49 by zhouxiaoyu
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 一志愿武理车辆 281 求调剂 +5 上岸研究生. 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:56 by only周
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +8 bradoner 2026-04-08 9/450 2026-04-09 13:43 by only周
[考研] 求考研材料调剂 +3 材化李可 2026-04-07 3/150 2026-04-08 00:21 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见