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cdl007

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】100金币求助怎么判断一个基因在通路里的重要性

如题
比如我认为FAK受调控和调控别的蛋白数目总和显著大于ILK,是否可以说在这个通路里FAK 比ILK重要
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boouy

银虫 (正式写手)

Knock out之后比较。
6楼2010-01-03 12:50:26
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qingfengwu

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cdl007(金币+20,VIP+0):我也有这方面的想法,有机会多多交流 1-10 19:28
我觉得具体问题具体分析吧。现在发展的生物学还不能说一个复杂的信号通路中谁重要谁不重要吧。

在某个生物学过程中,其中一条信号通路被激活了,比如cdc42-Rac-MEK-ERK ;在另外一各生物学过程中,另外一条信号通路被激活了,比如Src-Rho-PIP3-Ca-CaMKII。这两条信号通路在一定条件下会发生crosstalk,在另外一个条件下不会发生crosstalk。或者某个分子在比较多的生物学过程中都参与了,但是对于其中某个生物学过程它的重要性并不是很大。举个例子,有很多scaffolding protein在众多的生物学过程中都参与了,但是你不能说它的作用比那些趴在它上面的功能蛋白重要。

我们曾经试图用软件分析一个复杂通路,来寻找你所说的结点蛋白吧。但是计算结果不是很convincing。我觉得,你问的问题是一个很大的科学哲学问题,终有一天它会得到解决的,但是现在还不行,这需要很多信息生物学家和试验生物学家和数学家将来相互合作来解决这个复杂混沌理论中的问题。
2楼2009-12-31 17:25:53
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caoliang38

铁虫 (小有名气)

生物信息学可以预测吧
3楼2009-12-31 18:04:58
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

我觉得不能从一个基因调控的蛋白的数目去判定一个基因的作用,FAK虽然调控的基因很多,但是它对调控基因的影响程度是不一定的,而ILK虽然影响的少,但是若ILK失活后,其调控的蛋白没有任何活性了,也就不能说它不重要了。所以重不重要还是要将基因敲除或者抑制后来看效果吧!
4楼2009-12-31 19:48:45
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