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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】CoMFA,和文献方法一样，为什么自己得的Q2就那么低呢
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】CoMFA,和文献方法一样，为什么自己得的Q2就那么低呢 已有3人参与

各位虫友，大家好，马上就新年到了，先预祝各位，新年快乐！心想事成！

     研一的我，学COMFA已经半年了，觉得深的东西还是不懂，浅的略懂，可以把流程做完，但对于结果的调整，把差的Q2调到好的Q2值还只会皮毛。
   
   最近重复了一篇文献，和它做法一模一样（哦，文献中已经写出的做法，但在构象的具体选择没有，一般文献也都不会写这些），但是它得的Q2值是0.8或0.9多，可是我的值只有负值，后来我调了下网格设置，也只有0.058都不到0.1

   也不知道大家，有没有遇到和我一样的问题？

  我调了好久了，但是还是没有得到合适的，不到0.3，这个问题困扰了我很久了，但是还是没有得到好的值，到是看了不少Q2的文章，大致是些REVIEW，没有教如何提高的

          希望各位虫友一起来说说~~
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1楼 2009-12-30 17:41:41
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mike0601

木虫 (正式写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-21 12:13
和叠合的方法有关   另外分子优化的方法也有关系    画分子时单双键的位置都会有影响
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2楼2010-03-21 12:12:56
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)
哦，我明白了，原来，立体异构时，画分子的立体构象，有些出现错误了，呵呵，真是太粗心了

    谢谢大家了！
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3楼2010-03-25 09:14:28
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碧落红妆

可是我在做的时候构象都是完全正确的，得到的结果也和原来的文献不同啊
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4楼2010-04-07 16:58:02
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-07 20:07
有些文献，在网格设置，这些没有告诉清楚的
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5楼2010-04-07 19:26:56
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tingjun

木虫 (小有名气)
有些文献在优化分子或者画分子时就有一些设置，比如局部优化等，这些都会影响结果的
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6楼2010-04-09 10:03:12
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