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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 【求助/交流】启动子
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cxl_yll

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】启动子

我要研究铁胁迫下一个基因的启动子，我要找这个基因的顺式作用元件，但是我用删除试验构建不同长度的启动子片段，连接上GUS转化到拟南芥中，但是检测到的GUS活性没有规律，所以我找不到顺式作用元件，这是为什么啊？
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1楼 2009-12-26 13:45:30
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cxl_yll

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lzhwin at 2009-12-26 19:58:
不太明白，怎么算是有规律呢？

可以结合现在很多的生物信息网站预测元件的位置。另外还需要结合凝胶阻滞和染色质免疫共沉淀一起才能确定吧？

现在的网站预测软件好像预测不到与缺铁相关的顺式元件，而且我是先找到顺式元件，然后再利用找到的顺式元件在酵母单杂交下找出转录因子。  
   没有规律的意思就是：用删除试验找顺式元件，如果删除的某一序列连接上GUS转化后，检测该序列的GUS活性显著降低，说明顺式作用元件就在删除的这段序列中。但是我现在做出的好几个删除片段的GUS活性没有这样的规律。
   请帮忙分析一下这是什么原因。谢谢
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3楼2009-12-26 23:43:35
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lzhwin

木虫 (正式写手)
★
1949stone(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-26 21:09
不太明白，怎么算是有规律呢？

可以结合现在很多的生物信息网站预测元件的位置。另外还需要结合凝胶阻滞和染色质免疫共沉淀一起才能确定吧？
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2009-12-26 19:58:42
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shenye.judy

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
实验重复性好吗？
要不筛除的序列片段大些，这样是不是明显一点？
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4楼2009-12-27 10:07:14
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platanus

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
片段有多长呢？你的删除后的表达与全长的表达之间的差异怎么样呢?是不是可以跟楼上说的一样啊，确定大区域之后再在这个大区域里面做细一点呢？
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2009-12-31 22:07:34
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