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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-15 11:01
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-03-15 09:15:30:

呵呵,一直没用过Linux.很多人都推荐用,毕竟Window下运行很多计算软件真的很慢~呵呵

呵呵,不要害怕Linux,我刚开始时也不愿意换,觉得Windows毕竟好用,慢就慢点吧,可是很多程序对Linux的支持更好,而且运行起来速度不是一个层次上的,所以还是推荐在Linux下计算。
11楼2010-03-15 09:29:29
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-15 11:01
研究蛋白和小分子作用有两种方法
dock和MD, 前者速度快, 后者精度高
而namd 仅能MD
如果计算资源不够, 要处理的小分子又多的话, 还是不要考虑namd 了

至于linux, 我觉得如果经费允许, 还是花几千块钱配个台式机吧, 显示器的不要
namd和vmd在linux 和windows 上面的操作方法几乎没有差别, 但速度快的多
任务就在那上面算, 效率会高很多

[ Last edited by bay__gulf on 2010-3-15 at 10:21 ]
12楼2010-03-15 10:18:20
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-03-15 09:29:29:

呵呵,不要害怕Linux,我刚开始时也不愿意换,觉得Windows毕竟好用,慢就慢点吧,可是很多程序对Linux的支持更好,而且运行起来速度不是一个层次上的,所以还是推荐在Linux下计算。

恩恩,可以考虑尝试一下啊了~我看Gromacs,Autodock什么的貌似在Linux下都能运行,这几天花了一点时间找到了Gromacs的Win版,貌似速度还行~呵呵,以前用VMD500ps要跑七天~我的烂电脑啊~哈哈
13楼2010-03-15 15:59:45
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