应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】问个 g03 内存分配的问题，谢谢！
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/2返回列表12下一页
查看: 1032  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 snoopyzhao 的 6 个金币

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】问个 g03 内存分配的问题，谢谢！

主要是看不懂帮助中所说的 :-(

我现在有一台机器，配 16G 内存，2个4核CPU

可供 Gaussian 使用的总的最大内存为 12GB，可以全部使用8个核进行计算。

请问我该如何写 %mem 和 %nprocs

我现在计算 MP2 Freq 中使用的设置是 %mem=12GB %nprocs=8，但只有 3 个核在工作……

请问我该如何设置，才能使 8 个核全部参加工作？

谢谢！！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-12-25 15:43:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
先看看uname -ra的信息
赞一下 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2009-12-25 16:50:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
%mem=1400MB
回复此楼
技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
3楼2009-12-25 16:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengfc

金虫 (正式写手)
8核的话要用linda并行
赞一下 回复此楼
4楼2009-12-25 17:01:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2009-12-25 16:50:
先看看uname -ra的信息

谢谢，uname -ra 输出信息如下：

Linux localhost.localdomain 2.6.18-92.el5 #1 SMP Tue Jun 10 18:51:06 EDT 2008 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
赞一下 回复此楼
5楼2009-12-25 20:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by coolrainbow at 2009-12-25 16:53:
%mem=1400MB

这个运行不下小，中间出错，可能与我的体系有关，现在还不知道原因……
赞一下 回复此楼
6楼2009-12-25 20:01:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by mengfc at 2009-12-25 17:01:
8核的话要用linda并行

我目前用的这个版本似乎不用，因为之前我跑过一些计算，top 中显示全部 CPU 都参与了运算。
赞一下 回复此楼
7楼2009-12-25 20:02:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llhxaustin

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+4,VIP+0): 12-26 20:31
snoopyzhao(金币+2,VIP+0):我现在就是在做 MP2 FREQ，卡在 l906 这一步了，似乎特别慢…… 12-30 01:03
体系有多大？这个很重要。
如果在20个以内，
%mem＝80MW 和 %nprocs＝8就会很快了啊，多了也没用
如果是UNIX系统，你交上作业后可以TOP一下，看内存在每个LINK的时候的分配情况你就清楚应该用多少了。如果不够用，作业跳出后会告诉你应该加到多大的内存的，建议的。稍微多给点儿也行。

我碰到过一个不大的体系，给了好大的内存，结果导致L301之前做了好几十分钟，CPU利用率几乎是0，也不知是什么原因。如果是MP2　FREQ，最注意控制%mem=和maxdisk=，这二个选项控制合适，会使你的作业快得很。
赞一下(12人) 回复此楼
8楼2009-12-26 11:14:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 12-27 10:43
snoopyzhao(金币+1,VIP+0):谢谢，看 gaussian 的手册说，gaussian 会自己根据已有的资源进行计算策略的选择…… 12-30 01:02
引用回帖:
Originally posted by llhxaustin at 2009-12-26 11:14:
体系有多大？这个很重要。
如果在20个以内，
%mem＝80MW 和 %nprocs＝8就会很快了啊，多了也没用
如果是UNIX系统，你交上作业后可以TOP一下，看内存在每个LINK的时候的分配情况你就清楚应该用多少了。如果不够 ...

用gaussian做计算，并不是内存越大越好，关键是要合适，这个可以自己估算一下多大比较合适,估算方法见《Explore……》这本书。我忘了是第几章了。

如果体系太小，高斯根本用不到那么大的资源，白白浪费
赞一下(12人) 回复此楼
9楼2009-12-26 13:09:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★ ★ ★
erylingjet(金币+3,VIP+0):感谢交流 12-27 10:43
snoopyzhao(金币+1,VIP+0):我现在的机器在您提到的这些方面都没有问题，呵呵…… 12-30 01:04
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2009-12-25 20:00:


谢谢，uname -ra 输出信息如下：

Linux localhost.localdomain 2.6.18-92.el5 #1 SMP Tue Jun 10 18:51:06 EDT 2008 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

test3-p@node1 ~]$ uname -ra
Linux node1 2.6.9-78.ELlargesmp #1 SMP Wed Jul 9 16:03:59 EDT 2008 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
[test3-p@node1 ~]$ free -m
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:         96677       6894      89783          0        116       4785
-/+ buffers/cache:       1992      94685
Swap:         8095          0       8095

Tasks: 271 total,  17 running, 254 sleeping,   0 stopped,   0 zombie
Cpu0  : 72.7% us, 18.2% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  9.1% si
Cpu1  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu2  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu3  : 80.0% us, 10.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi, 10.0% si
Cpu4  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu5  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu6  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu7  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu8  :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu9  : 80.0% us, 10.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi, 10.0% si
Cpu10 : 100.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu11 :  0.0% us,  0.0% sy,  0.0% ni, 100.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu12 : 72.7% us, 18.2% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  9.1% si
Cpu13 : 80.0% us, 10.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi, 10.0% si
Cpu14 : 88.9% us, 11.1% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu15 : 88.9% us, 11.1% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu16 : 80.0% us, 10.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi, 10.0% si
Cpu17 : 80.0% us, 10.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi, 10.0% si
Cpu18 : 80.0% us, 20.0% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu19 : 88.9% us, 11.1% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  0.0% si
Cpu20 : 72.7% us, 18.2% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  9.1% si
Cpu21 : 81.8% us,  9.1% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  9.1% si
Cpu22 : 77.8% us, 11.1% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi, 11.1% si
Cpu23 : 72.7% us, 18.2% sy,  0.0% ni,  0.0% id,  0.0% wa,  0.0% hi,  9.1% si
Mem:  98998188k total,  7061404k used, 91936784k free,   119596k buffers
Swap:  8289532k total,        0k used,  8289532k free,  4900052k cached
[test3-p@node1 ~]$ cat /etc/redhat-release
Red Hat Enterprise Linux AS release 4 (Nahant Update 7
注意你安装的时候，调整你的内核参数；
看看这个机器，使用的是RHEL 4.7
有6个4核心的CPU， 96GiB内存，
高斯作业可以同时使用这24个CPU (效率比16个快不了多少)

ELlargesmp 这个是大内存支持！
我没有做过，不知道如何弄出来这个....
我用的机器，都没有这么大内存的...
赞一下(11人) 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
10楼2009-12-27 09:06:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 snoopyzhao 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 工科求调剂 +13 11ggg 2026-04-03 13/650 2026-04-05 05:26 by houyaoxu
[考研] 考研调剂 +10 小sun要好运 2026-04-04 10/500 2026-04-04 23:14 by lqwchd
[考研] 一志愿安徽某211 0703化学总分339求调剂 +6 晚风不晚 2026-04-04 6/300 2026-04-04 20:11 by dongzh2009
[考研] 一志愿沪9，求生物学调剂，326分 +6 刘墨墨 2026-04-04 6/300 2026-04-04 19:44 by 唐沐儿
[考研] 359求调剂 +7 hhhhaaaa$ 2026-04-04 7/350 2026-04-04 18:49 by imissbao
[考研] 363求调剂 +7 zh096 2026-04-04 7/350 2026-04-04 17:13 by dongzh2009
[考研] 求调剂 +5 Hll胡 2026-04-04 5/250 2026-04-04 16:49 by dongzh2009
[考研] 336求调剂 +8 kiyy 2026-04-01 8/400 2026-04-03 19:41 by lijunpoly
[考研] 复试调剂 +5 春日来信- 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:01 by buqi613
[考研] 一志愿中国科学院大学265求调剂 +9 恬淡ye 2026-03-31 10/500 2026-04-03 11:10 by txp1986
[考研] 085600 295分求调剂 +19 W55j 2026-03-30 23/1150 2026-04-03 09:53 by 千千运气
[考研] 312 化工或制药调剂 +8 小小墨123 2026-04-02 9/450 2026-04-03 09:12 by zhouxiaoyu
[考研] 材料340分调剂 +7 夏夜晚风_long 2026-04-02 9/450 2026-04-02 21:20 by dongzh2009
[考研] 农学考研求调剂 +3 dkdkxm 2026-04-01 3/150 2026-04-02 16:04 by wangjagri
[考研] 0832食品科学与工程学硕282调剂 +4 鱼在水中游a 2026-04-02 7/350 2026-04-02 14:12 by baoball
[考研] 279求调剂 +6 学而思兮知 2026-04-01 6/300 2026-04-02 09:16 by vgtyfty
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突， 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 一志愿西安交大材料学硕（英一数二）347，求调剂到高分子/材料相关专业 +7 zju51 2026-03-31 9/450 2026-04-01 19:35 by CFQZAFU
[考研] 349求调剂 +6 吃的不少 2026-04-01 6/300 2026-04-01 17:55 by JYD2011
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭