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snoopyzhao至尊木虫 (职业作家)
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[交流]
【求助】问个 g03 内存分配的问题，谢谢！
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主要是看不懂帮助中所说的 :-( 我现在有一台机器，配 16G 内存，2个4核CPU 可供 Gaussian 使用的总的最大内存为 12GB，可以全部使用8个核进行计算。 请问我该如何写 %mem 和 %nprocs 我现在计算 MP2 Freq 中使用的设置是 %mem=12GB %nprocs=8，但只有 3 个核在工作…… 请问我该如何设置，才能使 8 个核全部参加工作？ 谢谢！！ |
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2楼2009-12-25 16:50:53
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6楼2009-12-25 20:01:08
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7楼2009-12-25 20:02:15
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yjcmwgk(金币+4,VIP+0): 12-26 20:31
snoopyzhao(金币+2,VIP+0):我现在就是在做 MP2 FREQ，卡在 l906 这一步了，似乎特别慢…… 12-30 01:03
yjcmwgk(金币+4,VIP+0): 12-26 20:31
snoopyzhao(金币+2,VIP+0):我现在就是在做 MP2 FREQ，卡在 l906 这一步了，似乎特别慢…… 12-30 01:03
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体系有多大？这个很重要。 如果在20个以内， %mem＝80MW 和 %nprocs＝8就会很快了啊，多了也没用 如果是UNIX系统，你交上作业后可以TOP一下，看内存在每个LINK的时候的分配情况你就清楚应该用多少了。如果不够用，作业跳出后会告诉你应该加到多大的内存的，建议的。稍微多给点儿也行。 我碰到过一个不大的体系，给了好大的内存，结果导致L301之前做了好几十分钟，CPU利用率几乎是0，也不知是什么原因。如果是MP2 FREQ，最注意控制%mem=和maxdisk=，这二个选项控制合适，会使你的作业快得很。 |
8楼2009-12-26 11:14:32
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9楼2009-12-26 13:09:47
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erylingjet(金币+3,VIP+0):感谢交流 12-27 10:43
snoopyzhao(金币+1,VIP+0):我现在的机器在您提到的这些方面都没有问题，呵呵…… 12-30 01:04
erylingjet(金币+3,VIP+0):感谢交流 12-27 10:43
snoopyzhao(金币+1,VIP+0):我现在的机器在您提到的这些方面都没有问题，呵呵…… 12-30 01:04
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test3-p@node1 ~]$ uname -ra Linux node1 2.6.9-78.ELlargesmp #1 SMP Wed Jul 9 16:03:59 EDT 2008 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux [test3-p@node1 ~]$ free -m total used free shared buffers cached Mem: 96677 6894 89783 0 116 4785 -/+ buffers/cache: 1992 94685 Swap: 8095 0 8095 Tasks: 271 total, 17 running, 254 sleeping, 0 stopped, 0 zombie Cpu0 : 72.7% us, 18.2% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 9.1% si Cpu1 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu2 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu3 : 80.0% us, 10.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 10.0% si Cpu4 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu5 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu6 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu7 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu8 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu9 : 80.0% us, 10.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 10.0% si Cpu10 : 100.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu11 : 0.0% us, 0.0% sy, 0.0% ni, 100.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu12 : 72.7% us, 18.2% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 9.1% si Cpu13 : 80.0% us, 10.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 10.0% si Cpu14 : 88.9% us, 11.1% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu15 : 88.9% us, 11.1% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu16 : 80.0% us, 10.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 10.0% si Cpu17 : 80.0% us, 10.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 10.0% si Cpu18 : 80.0% us, 20.0% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu19 : 88.9% us, 11.1% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 0.0% si Cpu20 : 72.7% us, 18.2% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 9.1% si Cpu21 : 81.8% us, 9.1% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 9.1% si Cpu22 : 77.8% us, 11.1% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 11.1% si Cpu23 : 72.7% us, 18.2% sy, 0.0% ni, 0.0% id, 0.0% wa, 0.0% hi, 9.1% si Mem: 98998188k total, 7061404k used, 91936784k free, 119596k buffers Swap: 8289532k total, 0k used, 8289532k free, 4900052k cached [test3-p@node1 ~]$ cat /etc/redhat-release Red Hat Enterprise Linux AS release 4 (Nahant Update 7 注意你安装的时候，调整你的内核参数； 看看这个机器，使用的是RHEL 4.7 有6个4核心的CPU， 96GiB内存， 高斯作业可以同时使用这24个CPU (效率比16个快不了多少) ELlargesmp 这个是大内存支持！ 我没有做过，不知道如何弄出来这个.... 我用的机器，都没有这么大内存的... |
10楼2009-12-27 09:06:56
