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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 【求助/交流】6碱基的低频内切酶和4碱基高频内切酶酶切条件之差异？
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yf-deng

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】6碱基的低频内切酶和4碱基高频内切酶酶切条件之差异？

要疯了，做AFLP选则6碱基的低频内切酶(HindIII-A/AGCTT，EcoRI-GAATT/C，PstI-CTGCA/G)老是切不动（至少无明显的酶切迹象），
而4碱基的高频内切酶（TaqI-T/CGA，MseI-T/TAA）则能切的很好，不知道大家有何高见？难道是6碱基低频内切酶对DNA的质量要求非常高（杂质污染要求高）？
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1楼 2009-12-16 09:21:11
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yf-deng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by pal2004 at 2009-12-18 09:45:
理论上，4碱基识别位点在基因组中出现的概率是6碱基识别位点的16倍，也就是说，如果DNA完整度不好，各DNA片段中出现4碱基识别位点的概率比6碱基出现的概率大至少一个数量级。所以有可能DNA片段中已没有你用的6碱基 ...

谢谢pal2004站友！您的意思是说有可能是我的DNA质量不高，导致6碱基的酶切位点无法识别了吗？从图上看我的DNA应该还可以呀！真要崩溃了！
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7楼2009-12-19 11:27:50
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yf-deng

金虫 (正式写手)
这是另一个酶切结果
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2楼2009-12-16 09:21:46
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pal2004

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
对呀，你的DNA很可能完整度不好。
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3楼2009-12-16 09:53:44
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yf-deng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by pal2004 at 2009-12-16 09:53:
对呀，你的DNA很可能完整度不好。

何以见得呢？谢谢您的回复！
赞一下 回复此楼
4楼2009-12-16 10:31:01
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