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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】gromacs进行EM时出现下面的问题，怎么办？
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易风朔儿

金虫 (知名作家)

[交流] 【求助】gromacs进行EM时出现下面的问题，怎么办？

问个比较弱的问题，我在用gromacs进行EM，mdrun后出现以下提示：
     Steepest Descents did not converge to Fmax < 10 in 10001 steps.
我的体系约有35000个原子，我已经延长了nsteps到15000，还是解决不了，请教高人这是什么原因？怎么解决啊？另外，如何指导我的并行成功了？
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1楼 2009-12-08 13:50:42
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易风朔儿

金虫 (知名作家)
谢谢楼上，我把收敛值改为100，也还是不行啊！具体提示是这样的：
  Stepsize converged to machine precision,
but not to the requested precision Fmax < 100
楼上还有什么办法吗？谢谢！
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3楼2009-12-10 16:16:33
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 14:04
收敛标准很高啊，一般不用到10吧
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2楼2009-12-09 20:31:04
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 14:04
不知道你下一步要做什么？一般1000足够
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4楼2009-12-10 20:08:06
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢，欢迎常来交流讨论 12-23 14:33
你可以换个别的方法看下，比如CG，有时候我用CG就能很快到收敛，但是最速下降就不行，我也不知道为什么。。。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2009-12-14 22:11:38
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