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易风朔儿

金虫 (知名作家)

[交流] 【求助】gromacs进行EM时出现下面的问题,怎么办?

问个比较弱的问题,我在用gromacs进行EM,mdrun后出现以下提示:
     Steepest Descents did not converge to Fmax < 10 in 10001 steps.
我的体系约有35000个原子,我已经延长了nsteps到15000,还是解决不了,请教高人这是什么原因?怎么解决啊?另外,如何指导我的并行成功了?
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 14:04
收敛标准很高啊,一般不用到10吧
2楼2009-12-09 20:31:04
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易风朔儿

金虫 (知名作家)

谢谢楼上,我把收敛值改为100,也还是不行啊!具体提示是这样的:
  Stepsize converged to machine precision,
but not to the requested precision Fmax < 100
楼上还有什么办法吗?谢谢!
3楼2009-12-10 16:16:33
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 14:04
不知道你下一步要做什么?一般1000足够
4楼2009-12-10 20:08:06
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢,欢迎常来交流讨论 12-23 14:33
你可以换个别的方法看下,比如CG,有时候我用CG就能很快到收敛,但是最速下降就不行,我也不知道为什么。。。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2009-12-14 22:11:38
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易风朔儿

金虫 (知名作家)

好的,我再试试!
6楼2009-12-15 10:24:50
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