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tuodecai

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】10Kb长片段连接求助 急!!!

向各位仁者求助,谁有连过大片段的经验?或有用过invitrogen TOPO XL PCR Cloning Kit 的吗?该盒子的载体是说可以连3—10kb的片段,我的片段就有10kb,可我连了两次了都没连上的。转化效率特高,每个板上长了几百个,可鉴定插入的都是些才1kb的小片段。希望师兄师姐们给点儿建议,或有更好的载体推荐一下。先谢谢了!
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won7

金虫 (小有名气)


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Originally posted by tuodecai at 2009-12-9 14:22:


   谢谢!我是按试剂盒的要求做胶回收的,也没在紫外下照,而且回收后跑胶感觉效果也挺好的,比较纯,也没见小片段等杂带,但浓度不高。所以我应该不能将回收产物再做一次胶回收了,因为浓度低了跑胶是看不见 ...

这个试剂盒我连过3次,均是一次成功,所以感觉这个试剂盒还不错。我也是使用150ul涂板,长得也不少,没有具体估算,但应该在500个以上。我挑12个克隆,有8-10个是与目的片段相等的,测其中2个均为目的片段。只有一次检测中出现1个空载,其余均有插入。

     阳性鉴定也是用菌液PCR方法,10ul体积中加1ul菌液。引物用试剂带的通用引物即M13,但酶使用的是TAKARA的LA Taq。我用一般的Taq酶试过,但也没有产物,估计是片段太长,一般的酶难以扩增这么长的。预变性我都是用3min,太长的预变性时间是否有影响很难说,但其实没有必要用10min。

      连接模板的浓度我没有测,都是估计的。我想这不是主要问题吧。

     建议你采用扩增能够长片段的Taq重新检测一下,你认为没有连上的克隆,这可能是关键,因为我看试剂盒的连接原理,应该不会出现这么高的空载,除非你在电转时没有仔细而造成污染。

  最后祝你实验顺利,少挨批评!呵呵
7楼2009-12-09 17:02:45
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷


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请问下为什么插入了1kb的片段呢?目的片段没有做回收?
Thank-you,so-blue.
2楼2009-12-08 18:17:32
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won7

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
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amisking(金币+2,VIP+0): 12-8 20:23
我用过invitrogen TOPO XL PCR Cloning Kit 连接3kb的产物,效率很高。估计是你产物没有回收好,回收时不要用EB电泳,否则在紫外线下DNA受到损伤,对连接很有影响。建议用试剂盒附带的燃料和回收试剂回收。
3楼2009-12-08 20:12:49
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


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引用回帖:
Originally posted by tuodecai at 2009-12-8 11:34:
向各位仁者求助,谁有连过大片段的经验?或有用过invitrogen TOPO XL PCR Cloning Kit 的吗?该盒子的载体是说可以连3—10kb的片段,我的片段就有10kb,可我连了两次了都没连上的。转化效率特高,每个板上长了几百 ...

重新将你的大片段回收下,可能回收的不干净,跑胶的时候把电压放的慢一些,使大片段与小片段彻底分开。还有就是你连的时候是平端连还是用酶切位点呢?
4楼2009-12-08 22:24:24
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