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hj122

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助:新菌种如何建立系统发育树?

在实验室通过分离纯化得到一个未知的新菌种,现在对其进行16S rDNA扩增,已经送去测序,不知道得到基因序列后应该怎么利用Genbank对其进行16S rDNA基因序列核苷酸同源性比较?然后使用MEGA 2.1中的Neighbor Joining法绘制系统发育进化树。求教各位有经验的虫子!

因为是毫无经验的虫子,希望说的越详细越好。

实验卡在这里了,急求解决的办法,不胜感激!
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陈思容

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★
hj122(金币+3,VIP+0):非常感谢你的帮助,谢谢! 12-9 14:51
测序结果到NCBI上面Blast,选取得分比较高的、相同和不同种属的比对结果,用Clustalx比较,让后用Phylip做进化树软件,当然,还有Mega进化树软件等可以使用,不过我们实验室都用前面一个做的
13楼2009-12-09 11:06:25
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