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wuy069铁杆木虫 (正式写手)
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【求助】如何任意选取格点大小
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The grid size of the density cube may be chosen arbitrarily, thus balancing the computational cost of the coupling calculation with the errors introduced by the graining of space within the density cube. We find the Gaussian 94 default grid size to be quite conservative and the resulting coupling calculations lengthy. For the work here, we employ a coarser graining in which each cube element contains a volume of about 0.23 bohr^3, which is roughly twice the volume of the Gaussian 94 default。 在Gaussian中格点选取： 命令行加cube=(potential,cards) 分子坐标后空行 a.cube 输出文件名称(可要可不要) IFlag, X0, Y0, Z0 输出单元编号和网格原点。 N1, X1, Y1, Z1 X-方向的点数和点的间隔。 N2, X2, Y2, Z2 Y-方向的点数和点的间隔。 N3, X3, Y3, Z3 Z-方向的点数和点的间隔。 这样能任意选取格点吗？这篇文章思想是把跃迁密度cube分割成很多cube元，如何任意选取格点大小，怎样做到使cube元的体积大小为0.23bohr^3？ |
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以前我也问过这个问题 无人回答，后来我自己解决了它 解决过程在http://www.mdbbs.org/thread-19342-1-1.html |
2楼2009-12-05 10:39:36
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X0, Y0, Z0是cube最左下方的起点，通常是三个相等的负数。 X1、Y2、Z3为格点的步长。如果你要求cube元的体积大小为0.23bohr^3，那你对X1、Y2、Z3都取值0.23即可。 N1、N2、N3是三个坐标方向的格点数目。显然N*0.23就是空间一个轴的长度，它是你cube空间的大小。cube空间的大小要能装下你的分子。 N*0.23就是空间一个轴的长度，也决定了X0, Y0, Z0的取值。通常把坐标原点取在图的中心。 还要注意，如果IFlag取正值才是bohr单位，如果取负值，则单位采用埃。 [ Last edited by zhou2009 on 2009-12-8 at 11:28 ] |
3楼2009-12-07 15:38:31