| 查看: 278 | 回复: 2 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
wuy069铁杆木虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】如何任意选取格点大小
|
||
|
The grid size of the density cube may be chosen arbitrarily, thus balancing the computational cost of the coupling calculation with the errors introduced by the graining of space within the density cube. We find the Gaussian 94 default grid size to be quite conservative and the resulting coupling calculations lengthy. For the work here, we employ a coarser graining in which each cube element contains a volume of about 0.23 bohr^3, which is roughly twice the volume of the Gaussian 94 default。 在Gaussian中格点选取： 命令行加cube=(potential,cards) 分子坐标后空行 a.cube 输出文件名称(可要可不要) IFlag, X0, Y0, Z0 输出单元编号和网格原点。 N1, X1, Y1, Z1 X-方向的点数和点的间隔。 N2, X2, Y2, Z2 Y-方向的点数和点的间隔。 N3, X3, Y3, Z3 Z-方向的点数和点的间隔。 这样能任意选取格点吗？这篇文章思想是把跃迁密度cube分割成很多cube元，如何任意选取格点大小，怎样做到使cube元的体积大小为0.23bohr^3？ |
回复此楼» 猜你喜欢
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有94人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有3人回复
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
已经有16人回复
-
一志愿南大理论与计算化学方向（070300）342分，求调剂
已经有1人回复
-
欢迎化学、化工、物理、材料、或计算机背景的考研咨询
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有5人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+5,VIP+0): 12-7 17:53
wuy069(金币+4,VIP+0):谢谢 12-8 10:17
yjcmwgk(金币+5,VIP+0): 12-7 17:53
wuy069(金币+4,VIP+0):谢谢 12-8 10:17
|
X0, Y0, Z0是cube最左下方的起点，通常是三个相等的负数。 X1、Y2、Z3为格点的步长。如果你要求cube元的体积大小为0.23bohr^3，那你对X1、Y2、Z3都取值0.23即可。 N1、N2、N3是三个坐标方向的格点数目。显然N*0.23就是空间一个轴的长度，它是你cube空间的大小。cube空间的大小要能装下你的分子。 N*0.23就是空间一个轴的长度，也决定了X0, Y0, Z0的取值。通常把坐标原点取在图的中心。 还要注意，如果IFlag取正值才是bohr单位，如果取负值，则单位采用埃。 [ Last edited by zhou2009 on 2009-12-8 at 11:28 ] |
3楼2009-12-07 15:38:31
yjcmwgk
禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
- QC强帖: 38
- 应助: 165 (高中生)
- 贵宾: 16.999
- 金币: 554.6
- 散金: 39880
- 红花: 395
- 沙发: 2
- 帖子: 10406
- 在线: 1528.1小时
- 虫号: 448368
- 注册: 2007-11-01
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 科研工具资源
★ ★ ★ ★
wuy069(金币+4,VIP+0):谢谢 12-8 10:16
wuy069(金币+4,VIP+0):谢谢 12-8 10:16
|
以前我也问过这个问题 无人回答，后来我自己解决了它 解决过程在http://www.mdbbs.org/thread-19342-1-1.html |
2楼2009-12-05 10:39:36
