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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】sybyl如何在MINIMIZE时,不改变分子手性?

sybyl如何在MINIMIZE时,不改变分子手性?

在做MINIMIZE时,一对对映异构体优化后结果一模一样,请问如何,能固定手性原子进行优化?

    再请问,MINIMIZE是SYBYL里优化的常用选项么?
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houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 12-5 17:08
用Sybyl一般都是用这个模块的,手性是可以再画分子的时候设定的,板块上有R\S选项,选好后点一下原子再优化就好~
2楼2009-12-05 12:43:19
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

谢谢,我试了试,可以做到!我原先都不是用SYBYL画分子,用的是ISIS或是CHEMDRAW,然后用OPENBABEL转为MOL2

     结果在SYBYL里,一优化就重新默认了其它手性

     呵呵,现在在SYBYL里画分子,也挺方便的,手性还可以设定
3楼2009-12-05 18:35:27
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