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银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】sybyl如何在MINIMIZE时，不改变分子手性？

sybyl如何在MINIMIZE时，不改变分子手性？

在做MINIMIZE时，一对对映异构体优化后结果一模一样，请问如何，能固定手性原子进行优化？

再请问，MINIMIZE是SYBYL里优化的常用选项么？

1楼 2009-12-02 12:04:17

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木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 12-5 17:08

用Sybyl一般都是用这个模块的，手性是可以再画分子的时候设定的，板块上有R\S选项，选好后点一下原子再优化就好~

2楼2009-12-05 12:43:19

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银虫 (小有名气)

谢谢，我试了试，可以做到！我原先都不是用SYBYL画分子，用的是ISIS或是CHEMDRAW，然后用OPENBABEL转为MOL2

结果在SYBYL里，一优化就重新默认了其它手性

呵呵，现在在SYBYL里画分子，也挺方便的，手性还可以设定

3楼2009-12-05 18:35:27

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