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[交流]
我遇到的三个问题,请各位虫友看看,帮忙解决一下,谢谢!
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1.platon中的publish菜单中的calc all后在其产生的文件中有下面的文件 :: Resd # 1 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 0 0 1], 2 : [ 1 0 0], Plane: ( 0 1 0) :: Resd # 2 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 1 0 0], 2 : [ 0 0 1], Plane: ( 0 1 0) :: Resd # 3 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 1 0 0], 2 : [ 0 0 1], Plane: ( 0 1 0) :: Resd # 1 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 0 0 1], 2 : [ 1 0 0], Plane: ( 0 1 0) :: Resd # 2 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 1 0 0], 2 : [ 0 0 1], Plane: ( 0 1 0) :: Resd # 3 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 1 0 0], 2 : [ 0 0 1], Plane: ( 0 1 0) :: Resd # 0 - Infinite Two-Dimensional Network :: Base Vectors: 1 : [ 0 0 1], 2 : [ 1 0 0], Plane: ( 0 1 0) 以上内容是不是说明我的晶体的空间构型是二维网状结构,如果是这样的话,我在写文章是如何说明什么导致形成这个结构呢?π-π堆积,氢键等的共同作用还是单个的这些弱作用导致? 2.我的晶体课件中老师写了这样一段话: 平面和二面角的计算方法: 在ins文件中加MPLA n A1 > An+m 指令,精修后可计算出前n个原子的平面、所有(n+m个)输入原子偏离该平面的距离及与前一平面的二面角。 计算的结果可写入LST文件。 我有点不明白,看不懂便实际操作了一下 ins文件中添加命令 mpla 6 c1 > c12 lst 文件的结果为: Least-squares planes (x,y,z in crystal coordinates) and deviations from them (* indicates atom used to define plane) - 0.2636 (0.0156) x + 0.5772 (0.0171) y + 7.6660 (0.0057) z = 4.0912 (0.0115) * -0.0210 (0.0013) C1 * 0.0231 (0.0014) C2 * -0.0021 (0.0001) C12 Rms deviation of fitted atoms = 0.0181 我有些看不懂,请高手解释一下。 3.晶体课件中老师说道: 研究n个原子之间的共面性,是用最小二乘的方法,计算出所有n个原子偏离值(deviation)(δi)和最小的一个平面,称为最佳平面(best plane),也叫最小二乘平面(least-squares plane)。原子离开该平面的平均标准偏差(mean standard deviation)为σp它的值越小,共平面 性越好上面提到的数据在哪里找呢?谢谢大家! [ Last edited by 今天9088 on 2009-11-28 at 20:15 ] |
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