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今天9088

金虫 (小有名气)

[交流] 我遇到的三个问题,请各位虫友看看,帮忙解决一下,谢谢!

1.platon中的publish菜单中的calc all后在其产生的文件中有下面的文件
:: Resd # 1 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  0  0  1],     2 : [  1  0  0],  Plane: (  0  1  0)  

:: Resd # 2 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  1  0  0],     2 : [  0  0  1],  Plane: (  0  1  0)  

:: Resd # 3 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  1  0  0],     2 : [  0  0  1],  Plane: (  0  1  0)  

:: Resd # 1 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  0  0  1],     2 : [  1  0  0],  Plane: (  0  1  0)  

:: Resd # 2 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  1  0  0],     2 : [  0  0  1],  Plane: (  0  1  0)  

:: Resd # 3 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  1  0  0],     2 : [  0  0  1],  Plane: (  0  1  0)  

:: Resd # 0 - Infinite Two-Dimensional Network                                 
:: Base Vectors:     1 : [  0  0  1],     2 : [  1  0  0],  Plane: (  0  1  0)  
以上内容是不是说明我的晶体的空间构型是二维网状结构,如果是这样的话,我在写文章是如何说明什么导致形成这个结构呢?π-π堆积,氢键等的共同作用还是单个的这些弱作用导致?

2.我的晶体课件中老师写了这样一段话:
平面和二面角的计算方法:
在ins文件中加MPLA  n  A1 >  An+m 指令,精修后可计算出前n个原子的平面、所有(n+m个)输入原子偏离该平面的距离及与前一平面的二面角。
计算的结果可写入LST文件。
我有点不明白,看不懂便实际操作了一下
ins文件中添加命令 mpla 6 c1 > c12
lst 文件的结果为:
Least-squares planes (x,y,z in crystal coordinates) and deviations from them
(* indicates atom used to define plane)
- 0.2636 (0.0156) x + 0.5772 (0.0171) y + 7.6660 (0.0057) z = 4.0912 (0.0115)
*   -0.0210 (0.0013)  C1
*    0.0231 (0.0014)  C2
*   -0.0021 (0.0001)  C12
Rms deviation of fitted atoms =   0.0181
我有些看不懂,请高手解释一下。
3.晶体课件中老师说道:
   研究n个原子之间的共面性,是用最小二乘的方法,计算出所有n个原子偏离值(deviation)(δi)和最小的一个平面,称为最佳平面(best plane),也叫最小二乘平面(least-squares plane)。原子离开该平面的平均标准偏差(mean standard deviation)为σp它的值越小,共平面 性越好上面提到的数据在哪里找呢?谢谢大家!

[ Last edited by 今天9088 on 2009-11-28 at 20:15 ]
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