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【求助】新手请教一段程序的疑问....【已完结】
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我的疑问是,在do i=1,natom, read (1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i),这里do 做 一个循环,我后面的输出要求是输出,x(i-1),y(i-1),z(i-1), x(i),y(i),z(i),x(i+1),y(i+1),z(i+1)这3个坐标,这样输出可以吗?? open(1,file='benz-22.gro',status='unknown') !打开benz-co2.gro文件，并读取 do istep=1, nstep read(1,*) sysname read(1,*) natom do i=1, natom read(1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i) if (atomname .eq.'Cb') then r2=(x(i)-2.623)**2+(y(i)-2.554)**2 if (r2 .LT. 0.01932) then h2=(z(i)-2.608)**2 if (h2 .LT. 0.5776 .AND. z(i) .NE. 2.608) then open(20,file='aromaticco2.txt') write(20,*)'Oa',x(i-1),y(i-1),z(i-1) !输出这个Cb原子的坐标和Cb编号的前面和后面的一个原子的坐标。 write(20,*)'Cb',x(i),y(i),z(i) write(20,*)'Oc',x(i+1),y(i+1),z(i+1) [ Last edited by 波不动 on 2009-11-25 at 23:52 ] |
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我贴一个小一点的输入文件的格式 Generated by trjconv : Pure Mix - Yummie! (and some water) t= 1500.00000 !!这是体系的名字sysname 14 !!这是体系的原子个数 1BEN C1 1 3.265 3.036 3.125 1BEN C2 2 3.170 2.942 3.118 1BEN C3 3 3.038 2.983 3.131 1BEN C4 4 3.006 3.118 3.139 1BEN C5 5 3.106 3.216 3.143 1BEN C6 6 3.238 3.173 3.129 1BEN H7 7 3.368 3.000 3.126 1BEN H8 8 3.197 2.836 3.111 1BEN H9 9 2.957 2.912 3.141 1BEN H10 10 2.902 3.146 3.143 1BEN H11 11 3.317 3.247 3.126 1BEN C12 12 3.083 3.361 3.139 1BEN O13 13 2.979 3.418 3.111 1BEN H14 14 3.171 3.424 3.162 6.25808 6.25808 6.25808 !!这是盒子的大小 Generated by trjconv : Pure Mix - Yummie! (and some water) t= 1500.19995 14 1BEN C1 1 3.267 3.036 3.135 1BEN C2 2 3.173 2.940 3.131 1BEN C3 3 3.041 2.983 3.130 1BEN C4 4 3.004 3.117 3.124 1BEN C5 5 3.105 3.213 3.125 1BEN C6 6 3.237 3.172 3.135 1BEN H7 7 3.371 3.009 3.124 1BEN H8 8 3.196 2.836 3.109 1BEN H9 9 2.957 2.914 3.123 1BEN H10 10 2.904 3.152 3.101 1BEN H11 11 3.324 3.237 3.147 1BEN C12 12 3.074 3.358 3.109 1BEN O13 13 2.983 3.427 3.147 1BEN H14 14 3.161 3.406 3.059 6.25808 6.25808 6.25808 |
17楼2009-11-25 22:40:21
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2楼2009-11-24 12:43:59
maomao1210
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3楼2009-11-24 16:49:36
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open(1,file='benz-22.gro',status='unknown') !打开benz-co2.gro文件，并读取 do istep=1, nstep read(1,*) sysname read(1,*) natom I_emuch=1 do i=1, natom read(1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i) if (atomname .eq.'Cb') then r2=(x(i)-2.623)**2+(y(i)-2.554)**2 if (r2 .LT. 0.01932) then h2=(z(i)-2.608)**2 if (h2 .LT. 0.5776 .AND. z(i) .NE. 2.608) then Index_emuch(I_emuch)=i endif endif endif I_emuch=I_emuch+1 Enddo Do J_emuch=1,I_emuch open(20,file='aromaticco2.txt') if(ii.gt.1)write(20,*)'Oa',x(ii-1),y(ii-1),z(ii-1) !输出这个Cb原子的坐标和Cb编号的前面和后面的一个原子的坐标。 write(20,*)'Cb',x(ii),y(ii),z(ii) write(20,*)'Oc',x(ii+1),y(ii+1),z(ii+1) Enddo Enddo |
4楼2009-11-24 17:04:49
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