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tpp001

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】新手请教一段程序的疑问....【已完结】

我的疑问是,在do i=1,natom, read (1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i),这里do 做 一个循环,我后面的输出要求是输出,x(i-1),y(i-1),z(i-1), x(i),y(i),z(i),x(i+1),y(i+1),z(i+1)这3个坐标,这样输出可以吗??

open(1,file='benz-22.gro',status='unknown') !打开benz-co2.gro文件，并读取
        do istep=1, nstep
                read(1,*) sysname
                read(1,*) natom
                                do i=1, natom
                                        read(1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i)
                                                if (atomname .eq.'Cb') then
                                                        r2=(x(i)-2.623)**2+(y(i)-2.554)**2
                                                if (r2 .LT. 0.01932) then
                                                        h2=(z(i)-2.608)**2
                                                if (h2 .LT. 0.5776 .AND. z(i) .NE. 2.608) then
                                                        open(20,file='aromaticco2.txt')
                                                        write(20,*)'Oa',x(i-1),y(i-1),z(i-1) !输出这个Cb原子的坐标和Cb编号的前面和后面的一个原子的坐标。
                                                        write(20,*)'Cb',x(i),y(i),z(i)
                                                        write(20,*)'Oc',x(i+1),y(i+1),z(i+1)

[ Last edited by 波不动 on 2009-11-25 at 23:52 ]
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
1楼 2009-11-24 09:25:06
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nono2009

超级版主 (文学泰斗)

No gains, no pains.

优秀区长优秀区长优秀区长优秀区长优秀版主

可能是红的那一行的read问题

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
波不动(金币+2,VIP+0):辛苦了！ 11-25 22:35
do q=1,p
r=atomindex(p)
write(20,*)'Oa',x(r-1),y(r-1),z(r-1) !输出这个Cb原子的坐标和Cb编号的前面的一个原子的坐标。
write(20,*)'Cb',x(r),y(r),z(r)
write(20,*)'Oc',x(r+1),y(r+1),z(r+1)
read(1,*) xbox,ybox,zbox !读入盒子的大小
enddo
enddo
close(1)
end
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15楼2009-11-25 22:23:35
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jjdg

版主 (知名作家)

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你可以到http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1359058&page=6&fpage=1里面跟帖提问！
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努力学习！以正当途径！获得需要的知识！
2楼2009-11-24 12:43:59
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maomao1210

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tpp001 at 2009-11-24 09:25:
我的疑问是,在do i=1,natom, read (1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i),这里do 做 一个循环,我后面的输出要求是输出,x(i-1),y(i-1),z(i-1), x(i),y(i),z(i),x(i+1),y(i+1),z(i+1)这3个坐标,这样输出可以 ...

很显然不行，i=1的时候，你仅仅读入了对应第一个原子的信息，何来i=2？。
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3楼2009-11-24 16:49:36
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maomao1210

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
open(1,file='benz-22.gro',status='unknown') !打开benz-co2.gro文件，并读取
        do istep=1, nstep
                read(1,*) sysname
                read(1,*) natom
          I_emuch=1
           do i=1, natom
          read(1,*) molname,atomname,index,x(i),y(i),z(i)
           if (atomname .eq.'Cb') then
             r2=(x(i)-2.623)**2+(y(i)-2.554)**2
            if (r2 .LT. 0.01932) then
             h2=(z(i)-2.608)**2
        if (h2 .LT. 0.5776 .AND. z(i) .NE. 2.608) then

             Index_emuch(I_emuch)=i
               endif
               endif
               endif
            I_emuch=I_emuch+1
          Enddo

         Do J_emuch=1,I_emuch
        open(20,file='aromaticco2.txt')
       if(ii.gt.1)write(20,*)'Oa',x(ii-1),y(ii-1),z(ii-1) !输出这个Cb原子的坐标和Cb编号的前面和后面的一个原子的坐标。
        write(20,*)'Cb',x(ii),y(ii),z(ii)
        write(20,*)'Oc',x(ii+1),y(ii+1),z(ii+1)        
           Enddo
          Enddo
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4楼2009-11-24 17:04:49
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