24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 910  |  回复: 9
当前主题已经存档。

xplc

金虫 (小有名气)

[交流] 降解速度计算, Vmax?

最近在做微生物降解实验,意欲计算微生物对于底物的降解速率。
开始的计划是根据最初的线性区域计算其斜率,以此作为降解速率Vmax。
结果得到以下系列数据,实在不知如何计算这个降解速率(尤其是20倍稀释的样品,看起来整个曲线都不是线性),恳请各路大侠出手相助,指条明路!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)

2楼2009-11-21 00:56:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmfang

荣誉版主 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+3,VIP+0):谢谢交流 11-21 11:03
引用回帖:
Originally posted by xplc at 2009-11-20 14:11:
最近在做微生物降解实验,意欲计算微生物对于底物的降解速率。
开始的计划是根据最初的线性区域计算其斜率,以此作为降解速率Vmax。
结果得到以下系列数据,实在不知如何计算这个降解速率(尤其是20倍稀释的样品 ...

应LZ站内消息求助。见Origin8.0附件。
线性拟合步骤如下:
1. 先画1-10组和1-20组的散点(Scatter)图Graph1和Graph2,
然后在Analysis|Fitting|Fit Linear|Open Dialog...,将“Fit Options”下的“Apparent Fit”后的可选方框打上勾号。然后按照默认。线性拟合后会在页面左侧栏出现Table1(对应Graph1)和Table2(对应Graph2)。
在Table中,“Intercept”表示与Y轴相交的Y坐标,就是y=a+b*x的截距a,而 “Slope”就是斜率b,也就是你所要的降解速率。

方东明
北京大学微电子学研究院

[ Last edited by dmfang on 2009-11-21 at 11:09 ]
3楼2009-11-21 10:57:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)

看到了方东明先生的数据拟合,貌似就是常规的linear fit。如此得到的R 平方值很小;这也是为什么我发帖求助的原因:我希望得到一个最初的斜率,因为随着时间推移,斜率一直在减少的。

哪位大侠再支招?

谢了
4楼2009-11-24 03:08:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0): 11-26 08:41
amisking(金币+10,VIP+0):代楼主奖励 12-1 08:15
一般降解动力学不是线性的。
V=Vmax*S/(Km+S)

如果您的数据里,0-2.5是底物浓度,可以用1/V和1/S作图。截距是1/Vmax,斜率是-Km/Vmax

1-10那组数据线性度不好,R2=0.7042
1-20那组,R2=0.8713
Vmax=0.4095
Km=0.20647
5楼2009-11-24 08:47:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by marineman at 2009-11-24 08:47:
一般降解动力学不是线性的。
V=Vmax*S/(Km+S)

如果您的数据里,0-2.5是底物浓度,可以用1/V和1/S作图。截距是1/Vmax,斜率是-Km/Vmax

1-10那组数据线性度不好,R2=0.7042
1-20那组,R2=0.8713
Vmax ...

多谢marineman 热心回复。

实际上表格中所列是底物浓度随时间的变化曲线,0-2.5是取样时间。就是说我手头有不同时间的S浓度。
按照 delta S /delta time 得出不同时间段的V之后,我试图采用 1/V和1/S作图,结果看起来比较诡异。

能否麻烦marineman帮忙看下。

谢了先
6楼2009-11-25 01:46:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活

怎么个怪异法?
7楼2009-11-26 08:33:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xplc at 2009-11-25 01:46:


多谢marineman 热心回复。

实际上表格中所列是底物浓度随时间的变化曲线,0-2.5是取样时间。就是说我手头有不同时间的S浓度。
按照 delta S /delta time 得出不同时间段的V之后,我试图采用 1/V和1/S作图 ...

你应该了解一下机理,这样才能明白整个计算过程。

第一组数据R2大于0.9
第二组数据R2大于0.7
8楼2009-11-26 10:29:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)

愿闻其详:怎么个机理法?请明示。

是如您先前所说:
V=Vmax*S/(Km+S)
plot 1/s verse 1/V 么?

还是有什么别的玄机?

BTW, 您所上传的数据好像有点移位了,
如果我没理解错的话,数据应该如下图:

根本就谈不上线性,这也是我为啥先前说数据怪异了
引用回帖:
Originally posted by marineman at 2009-11-26 10:29:


你应该了解一下机理,这样才能明白整个计算过程。


9楼2009-11-30 08:16:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
首先您要了解线性,不是R2〉0.999才是线性。

线性不好的原因,一个是数据点少,还有一个原因是数据的偏差。
10楼2009-11-30 11:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xplc 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-11 13/650 2026-04-14 19:18 by Art1977
[考研] 材料085601调剂 +32 何润采123 2026-04-10 34/1700 2026-04-14 08:47 by 木木mumu~
[考研] 机械还有还有名额吗?太难了 +8 笑笑袁 2026-04-10 8/400 2026-04-14 08:44 by screening
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 295分求调剂 +13 ?要上岸? 2026-04-10 13/650 2026-04-12 15:37 by laoshidan
[考研] 296求调剂 +14 汪!?! 2026-04-10 16/800 2026-04-12 10:48 by zhouyuwinner
[考研] 326求调剂 +6 Shansyn 2026-04-10 6/300 2026-04-12 09:46 by hammer3
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 调剂 +10 只叙离别辞 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:57 by 逆水乘风
[考研] 调剂 +6 青灯不负 2026-04-09 6/300 2026-04-11 20:35 by dongdian1
[考研] 270求调剂 +14 杨乐369 2026-04-11 14/700 2026-04-11 20:16 by 蓝云思雨
[考研] 0859,337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 11:34 by caotw2020
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +14 Eddieddd 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:58 by bljnqdcc
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 一志愿东北大学控制工程085406数二英二385,求调剂 +8 Ezra_Zhang 2026-04-09 8/400 2026-04-11 09:15 by 猪会飞
[考研] 考研调剂 +26 硕星赴 2026-04-09 27/1350 2026-04-10 22:24 by 猪会飞
[考研] 调剂 +19 小张ZA 2026-04-10 20/1000 2026-04-10 22:08 by 猪会飞
[考研] 初试分332,一志愿报考西北工业大学, +11 故人?? 2026-04-09 11/550 2026-04-09 21:54 by JineShine
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂,接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
信息提示
请填处理意见