应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 降解速度计算， Vmax？
101/1返回列表
查看: 869  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

xplc

金虫 (小有名气)

[交流] 降解速度计算， Vmax？

最近在做微生物降解实验，意欲计算微生物对于底物的降解速率。
开始的计划是根据最初的线性区域计算其斜率，以此作为降解速率Vmax。
结果得到以下系列数据，实在不知如何计算这个降解速率（尤其是20倍稀释的样品，看起来整个曲线都不是线性），恳请各路大侠出手相助，指条明路！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-11-20 14:11:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)
2楼2009-11-21 00:56:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmfang

荣誉版主 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+3,VIP+0):谢谢交流 11-21 11:03
引用回帖:
Originally posted by xplc at 2009-11-20 14:11:
最近在做微生物降解实验，意欲计算微生物对于底物的降解速率。
开始的计划是根据最初的线性区域计算其斜率，以此作为降解速率Vmax。
结果得到以下系列数据，实在不知如何计算这个降解速率（尤其是20倍稀释的样品 ...

应LZ站内消息求助。见Origin8.0附件。
线性拟合步骤如下：
1. 先画1-10组和1-20组的散点（Scatter）图Graph1和Graph2，
然后在Analysis|Fitting|Fit Linear|Open Dialog...，将“Fit Options”下的“Apparent Fit”后的可选方框打上勾号。然后按照默认。线性拟合后会在页面左侧栏出现Table1（对应Graph1）和Table2（对应Graph2）。
在Table中，“Intercept”表示与Y轴相交的Y坐标，就是y=a+b*x的截距a，而 “Slope”就是斜率b，也就是你所要的降解速率。

方东明
北京大学微电子学研究院

[ Last edited by dmfang on 2009-11-21 at 11:09 ]
赞一下(11人) 回复此楼
3楼2009-11-21 10:57:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)
看到了方东明先生的数据拟合，貌似就是常规的linear fit。如此得到的R 平方值很小；这也是为什么我发帖求助的原因：我希望得到一个最初的斜率，因为随着时间推移，斜率一直在减少的。

哪位大侠再支招？

谢了
赞一下 回复此楼
4楼2009-11-24 03:08:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0): 11-26 08:41
amisking(金币+10,VIP+0):代楼主奖励 12-1 08:15
一般降解动力学不是线性的。
V＝Vmax*S/（Km+S）

如果您的数据里，0-2.5是底物浓度，可以用1/V和1/S作图。截距是1/Vmax，斜率是-Km/Vmax

1-10那组数据线性度不好，R2＝0.7042
1-20那组，R2＝0.8713
Vmax＝0.4095
Km＝0.20647
赞一下(41人) 回复此楼
5楼2009-11-24 08:47:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by marineman at 2009-11-24 08:47:
一般降解动力学不是线性的。
V＝Vmax*S/（Km+S）

如果您的数据里，0-2.5是底物浓度，可以用1/V和1/S作图。截距是1/Vmax，斜率是-Km/Vmax

1-10那组数据线性度不好，R2＝0.7042
1-20那组，R2＝0.8713
Vmax ...

多谢marineman 热心回复。

实际上表格中所列是底物浓度随时间的变化曲线，0-2.5是取样时间。就是说我手头有不同时间的S浓度。
按照 delta S /delta time 得出不同时间段的V之后，我试图采用 1/V和1/S作图，结果看起来比较诡异。

能否麻烦marineman帮忙看下。

谢了先
赞一下 回复此楼
6楼2009-11-25 01:46:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活
怎么个怪异法？
回复此楼
7楼2009-11-26 08:33:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xplc at 2009-11-25 01:46:


多谢marineman 热心回复。

实际上表格中所列是底物浓度随时间的变化曲线，0-2.5是取样时间。就是说我手头有不同时间的S浓度。
按照 delta S /delta time 得出不同时间段的V之后，我试图采用 1/V和1/S作图 ...

你应该了解一下机理，这样才能明白整个计算过程。

第一组数据R2大于0.9
第二组数据R2大于0.7
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2009-11-26 10:29:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xplc

金虫 (小有名气)
愿闻其详：怎么个机理法？请明示。

是如您先前所说：
V＝Vmax*S/（Km+S）
plot 1/s verse 1/V 么？

还是有什么别的玄机？

BTW， 您所上传的数据好像有点移位了，
如果我没理解错的话，数据应该如下图：

根本就谈不上线性，这也是我为啥先前说数据怪异了
引用回帖:
Originally posted by marineman at 2009-11-26 10:29:


你应该了解一下机理，这样才能明白整个计算过程。
赞一下 回复此楼
9楼2009-11-30 08:16:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

marineman

至尊木虫 (知名作家)

爱八卦爱生活
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
首先您要了解线性，不是R2〉0.999才是线性。

线性不好的原因，一个是数据点少，还有一个原因是数据的偏差。
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2009-11-30 11:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xplc 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 求调剂一志愿海大，0703化学学硕304分，有大创项目，四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 306求调剂 +6 chuanzhu川烛 2026-03-18 6/300 2026-03-22 19:39 by 公瑾逍遥
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 广西大学材料导师推荐 +3 夏夏夏小正 2026-03-17 5/250 2026-03-21 22:20 by 金昊ML
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 材料专硕英一数二306 +7 z1z2z3879 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 295材料求调剂，一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭