24小时热门版块排行榜    

查看: 1197  |  回复: 0

周工谈仪器

铁虫 (初入文坛)

[交流] 巴恩斯实验标准是要鼠真实进洞还是只要规定的点进入洞口?

标准答案:巴恩斯迷宫的“进入目标洞(escape)”判定,通行做法是“鼠身体实质性进入”,不是“背上标记点碰到洞口线”就算。

但具体卡到什么程度,是“头肩过线”还是“四爪过线”,要看你 Methods 里怎么定、软件 ROI 怎么画。我拆清楚:

1. 为什么不能只按“标记点进洞口”算
巴恩斯迷宫里,标记点贴在背中线。鼠走到洞口,会探头嗅探→缩头→再探头→前爪搭边→整个钻下去。
如果软件只认“反光点坐标进入洞口 ROI”,那么鼠第一次探头嗅探时,背点可能已经在洞口上方 1–2 cm,算法直接判“进入”,但实际鼠还没逃进去,只是闻了闻。
这种判定会让逃逸潜伏期虚短 2–5 秒,而且不同鼠探头习惯不同,误差不是系统性的,CV 会炸。
2. 科研论文里普遍接受的“进入”定义

主流文献(如 Barnes 1980 原始法、以及 EthoVision/SMART 等系统预设)通常用:

Head-and-both-front-paws crossing the plane of the hole rim(头+双前爪越过洞口边缘)
也就是:
头的鼻尖过洞口内缘
两只前爪都踏进洞口
后半身还在外面也算“进入”(因为鼠接下来会缩进去)
比“四爪全进”宽松,比“标记点进 ROI”严。
3. 软件怎么落地这个定义
靠标记点轨迹硬算:把“进入”定义为标记点坐标进入洞口 ROI 且停留 ≥ X 帧。这是糙的,容易把探头算进去。
靠体型框(Bounding Box):软件跟踪鼠整体轮廓,判定“头肩区”进洞。比单点准。
靠人工辅助/半自动:视频回放时,操作员按空格键在“头肩进洞”那帧打点,软件记该帧时间。这是很多高分文章用的笨办法,稳!
我们常用系统做法:目标洞 ROI 画在洞口内缘收缩 5 mm 的圆,且要求标记点进 ROI 持续 ≥ 1 s​ + 同时检测到速度趋零(鼠在洞口停顿)。单点进但不停,不算;探头就跑,不算。
生理定义(头+双前爪)
自动判定补丁(ROI 收缩、停留、低速)
人工复核(防算法误判)
5. 只按“点进洞口”会出什么笑话
鼠在 20 个洞之间来回嗅,标记点扫过目标洞 ROI 三次,每次 0.3 秒——算法记“三次逃逸”,潜伏期取第一次,实际鼠根本没逃。
鼠把头探进去打喷嚏缩回,算一次逃逸,数据比真逃的还短。
审稿人一看“平均潜伏期 8 秒”就知道水(正常巴恩斯小鼠找洞 30–60 秒)。
6. 周工顺手补一句
我们给客户装巴恩斯模块时,默认不是“点进洞就停”,而是“头肩过内缘+停留 1s+速度趋零”三重条件,且 ROI 比物理洞口收 5 mm。客户如果嫌严,可以在软件里改成“四爪过线”,但 Methods 须和软件设置一字不差。
所以
真实进洞(头肩入洞)是金标准;
只让标记点扫过洞口线 = 不合规,除非你 Methods 明文说“我们以标记点进入洞口 ROI 为判定”并且接受这是近似(低分杂志可能放过,高分会被问);
最稳是头肩过内缘 + 停留 + 人工复核。

巴恩斯实验标准是要鼠真实进洞还是只要规定的点进入洞口?
回复此楼
做行为学软硬件支持,偶尔来答点轨迹识别和校准的坑。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 周工谈仪器 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见