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小白3521

金虫 (小有名气)

[交流] 双酶切啊,越切越没有

郁闷死了,这段时间做双酶切,最开始用的是takara的酶切的,我嫌切的久而且不亮,听说用fermentas的酶好,就换这个牌子的酶,结果这个酶反而切不下来,而且我现在用takara酶切,按照以前能够切出来的体系也切不出来了,很奇怪。会不会有种可能,是片段从质粒里丢失了?
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grief

铜虫 (初入文坛)

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1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 11-19 17:26
你切下来的片段是多少个碱基?碱基的数目和其亮度是成正比的。如果碱基少,酶切量又少,不亮是很正常的。
一般我们双酶切用的都是fermentas的酶,质粒大约1ug就可以了!
菌种最好保持其抗性压力,如果你不确定基因片段是否还在载体中,最好做个PCR鉴定下。
等待秋天
3楼2009-11-19 10:52:11
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heismeng

金虫 (小有名气)

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1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 11-19 17:26
多做些量吧 25做不出来的时候我都做100的体系
然后BSA加上 两个酶的比例再调一下
片段一般不会从质粒中丢失的 我好几个月的都继续切也没问题
2楼2009-11-19 10:43:19
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小白3521

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by grief at 2009-11-19 10:52:
你切下来的片段是多少个碱基?碱基的数目和其亮度是成正比的。如果碱基少,酶切量又少,不亮是很正常的。
一般我们双酶切用的都是fermentas的酶,质粒大约1ug就可以了!
菌种最好保持其抗性压力,如果你不确定基 ...

我的片段是400多的,我觉得我提的质粒就不是很亮,也不知道什么原因,用的试剂盒提的
4楼2009-11-19 11:07:49
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grief

铜虫 (初入文坛)

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1949stone(金币+1,VIP+0):很热情 11-19 17:26
如果你的菌不是低拷贝,那么就是试剂盒回收效率的问题了。
我们实验室提取质粒也是用试剂盒。一般我们摇菌时抗性的浓度会稍微多加点,在抗性的压力下,如果过夜摇菌的话,菌中的质粒就不会减少太多。一般是提取3-6ML菌液,加入2号试剂总时间不超过5min,洗脱的超纯水65度。
最后你洗脱完了,可以用移液器把溶液再转入柱子中,再离心洗脱一次,这样回收效率会高点。
等待秋天
5楼2009-11-19 15:27:38
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