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tancf

金虫 (小有名气)

[交流] 有关蛋白质和小分子作用的问题

想证明某种药物小分子是作用于我的蛋白质(一种核受体)的,可以通过那些实验来验证?向大家请教!
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tancf

金虫 (小有名气)

没有人做这方面么?
2楼2009-11-18 21:13:38
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
tancf(金币+2,VIP+0):谢谢~ 11-19 12:12
激光共聚焦
把你的小分子标荧光,处理细胞,然后打孔,靶蛋白用荧光抗体标记
看共定位
3楼2009-11-18 23:13:22
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)


tancf(金币+1,VIP+0):谢谢~ 11-19 12:13
biacore
4楼2009-11-19 08:13:40
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heismeng

金虫 (小有名气)

★ ★
tancf(金币+2,VIP+0):谢谢~ 11-19 12:13
相互作用的话SPR QCM可以做吧 不太懂哈哈 仅供参考
5楼2009-11-19 10:36:27
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nicknelson

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
tancf(金币+2,VIP+0):非常感谢! 11-21 12:25
SPR, IP后做质谱,或者用生物素标记化合物,IP后检测蛋白质。
6楼2009-11-20 11:19:12
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foreverjohn

金虫 (小有名气)

★ ★
tancf(金币+2,VIP+0):非常感谢! 11-21 12:26
我们实验室就在做这方面的!看你实验室有没有仪器,并且研究这种相互作用最好是用多种方法来证明!如果你有机合成比较熟的话,可以选用交联法或者接上荧光基团共定位,体外的方法有表面等离子共振(SPR)、石英晶体微天平(QCM)、微量热法(Microcalorimetry)、此外生物核磁共振(NMR)、晶体学都可以。
7楼2009-11-20 12:58:45
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qingfengwu

金虫 (小有名气)

试验 步骤

★ ★ ★ ★ ★
tancf(金币+5,VIP+0):非常感谢! 11-21 12:26
(1)共定位:

      化学小分子结合受体做confocal确定共定位是比较困难的,确实是需要交联的,但是具体交联的步骤不太清楚。如果是多肽或者内源性蛋白就容易的多,但是这个是不能证明有结合的,只能证明是有可能在一起。

(2)前面几位的意见非常好,看来都是学药学的,SPR,NMR都是非常好的证明方法,只是听说过,自己没有怎么做过。这些是证明binding所需要的。

(3)上面有个虫子说用生物素标记的方法,这个我觉得敏感性不够高,用同位素标记比较好,

     我们现在做一个配体和一个受体确定两者间的关系有很多种方法,你可以去google一下,或者去查一下教科书,配体受体的定义里面都有好几条,你要一一按照那几条去做,在所有这些方法中最经典的一个试验就是同位素标记试验,然后和你的那个核受体共孵育,然后检测。

(4)有条件的话去做一下受体的结晶,crystal structure的分析对于药物来讲非常重要,解析出来以后,你用计算机计算出核受体的一些口袋结构啊,特殊结构啊,用你的化学小分子的一些基团去比对,看看能不能有效结合上去。

所有这些试验全部完成,相信绝对是个top article。
8楼2009-11-20 13:14:51
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