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有关蛋白质和小分子作用的问题
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| 想证明某种药物小分子是作用于我的蛋白质(一种核受体)的,可以通过那些实验来验证?向大家请教! |
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2楼2009-11-18 21:13:38
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试验 步骤
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tancf(金币+5,VIP+0):非常感谢! 11-21 12:26
tancf(金币+5,VIP+0):非常感谢! 11-21 12:26
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(1)共定位: 化学小分子结合受体做confocal确定共定位是比较困难的,确实是需要交联的,但是具体交联的步骤不太清楚。如果是多肽或者内源性蛋白就容易的多,但是这个是不能证明有结合的,只能证明是有可能在一起。 (2)前面几位的意见非常好,看来都是学药学的,SPR,NMR都是非常好的证明方法,只是听说过,自己没有怎么做过。这些是证明binding所需要的。 (3)上面有个虫子说用生物素标记的方法,这个我觉得敏感性不够高,用同位素标记比较好, 我们现在做一个配体和一个受体确定两者间的关系有很多种方法,你可以去google一下,或者去查一下教科书,配体受体的定义里面都有好几条,你要一一按照那几条去做,在所有这些方法中最经典的一个试验就是同位素标记试验,然后和你的那个核受体共孵育,然后检测。 (4)有条件的话去做一下受体的结晶,crystal structure的分析对于药物来讲非常重要,解析出来以后,你用计算机计算出核受体的一些口袋结构啊,特殊结构啊,用你的化学小分子的一些基团去比对,看看能不能有效结合上去。 所有这些试验全部完成,相信绝对是个top article。 |
8楼2009-11-20 13:14:51












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