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灵思生物

金虫 (正式写手)

[交流] Circle RNA测序

 Circle RNA(Circular RNA),是一类不具有5'末端帽子和 3'末端 poly(A)尾巴、并以共价键形成稳定闭合环状结构的非编码 RNA 分子。Circle RNA 广泛存在于生物细胞中,对miRNA 起重要的调控作用,进而调控基因表达。随着高通量测序技术的发展,Circle RNA 在多种真核生物体内被大量鉴定出来,利用高通量测序技术,对生物样本中的Circle RNA 进行鉴定、表达丰度检测及结构分析,是RNA领域的研究热点,推动更深入的基因表达研究。
实验流程:
       样品RNA提取→RNA检测→去核糖体去线性RNA文库→Illumina PE150测序
分析流程:
        数据质控→参考基因组比对(mapping)→Circle RNA鉴定和预测→重复相关性评估

Circle RNA测序


Circle RNA测序-1
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