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灵思生物

金虫 (正式写手)

[交流] LncRNA测序

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt,有一些长度超过90kb、不编码蛋白的RNA。利用新一代高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,有助于科研工作者更快发现那些具有重要调控功能的lncRNA,分析其与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息还可对新的lncRNA进行预测及功能分析。
实验流程:
       样品RNA提取→RNA检测→去核糖体链特异性文库→Illumina PE150测序→生物信息分析
 分析流程:
       数据质控→参考基因组比对(mapping)→lncRNA鉴定和预测→重复相关性评估→差异表达lncRNA分析→差异lncRNA靶基因预测→靶基因功能分析

LncRNA测序


LncRNA测序-1
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