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灵思生物

金虫 (正式写手)

[交流] Small RNA测序--miRNA

 Small RNA是一大类调控分子。Small RNA包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等。Small RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA—特别是microRNA(miRNA)展开分析,利用高通量测序平台,对样本中富集到的18-32 nt的小RNA片段进行测序,对获得的有效数据进行序列长度分布统计,将筛选后的高质量序列分类注释,获得样品中包含的各组分及表达量信息,实现small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能注释等多项分析,满足客户对包含miRNA、siRNA、piRNA等多种small RNA类型的分析研究需求。
实验流程:
        样品RNA提取→RNA检测→回收miRNA→Illumina SE50测序→生物信息分析
分析流程:
      数据质控→参考基因组比对(mapping)→miRNA鉴定和预测→重复相关性评估→差异表达miRNA分析→差异miRNA靶基因预测→靶基因功能分析

Small RNA测序--miRNA


Small RNA测序--miRNA-1


Small RNA测序--miRNA-2
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