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dengyyqust铁虫 (小有名气)
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求助计算π...π堆积距离
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| 各位大侠，我的晶体结构中有双键与吡啶环是相互平行的，存在π...π堆积作用，请问如何精确计算出它们之间的间距（堆积距离），多谢了! |
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2楼2009-11-11 11:18:14
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3楼2009-11-11 11:22:44
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4楼2009-11-11 11:32:33
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π...π堆积作用有面对面（face-to-face)和错位面对面(offset faxe-to-face)两种，如果是前面一种，则可以用楼上两位方法计算，后面一种还是在xp里计算为好。方法就是mpln Cn(吡啶环原子)，即做吡啶环原子平面方程，就可以看到双键C原子到这个平面距离了。 对称码在diamond里就可以直接看到了。如果是在xp里，用info命令就可以计算出来的。 |
5楼2009-11-11 14:15:54
6楼2009-11-11 16:28:00
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7楼2009-11-11 17:10:13
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8楼2009-11-12 19:05:53
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9楼2009-11-15 21:58:15
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10楼2009-11-15 23:38:10
