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[交流] 【求助】请教一下在amber中的一个问题

Sample Text请教一下在amber中得到底物的top和par。如何将这两个文件与蛋白质的partop和inpcrd整合在一起，在amber里如何是程序识别底物 Sample TextSample Text

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 11:23 ]
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1楼 2009-11-10 17:50:52
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tiyang1987

木虫 (著名写手)
不知道咋弄，帮楼主顶起
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2楼2009-11-10 19:45:31
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
路过，帮楼主顶起。可怜我不用amber！
赞一下(1人) 回复此楼
分子模拟的主页http://varmilion.tk/
3楼2009-11-10 20:07:35
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z6242948

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-27 10:58
不需要底物的top和par  如果底物中不包含非标准残基，那么把底物和蛋白构成的复合物的pdb直接导入leap中创建就行  如果包含非标准残基  那么就需要用到antechamber创建prep和frcmod文件  导入leap中  再导入复合物pdb创建即可
赞一下(11人) 回复此楼
4楼2009-11-27 10:41:35
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