24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (4882)
>导师招生 (1384)
>虫友互识 (663)
>休闲灌水 (647)
>考博 (306)
>文献求助 (275)
>论文道贺祈福 (195)
>论文投稿 (131)
>硕博家园 (127)
>招聘信息布告栏 (112)
>教师之家 (52)
>学术会议 (47)
>基金申请 (47)
>博后之家 (43)
>考研 (42)
>外文书籍求助 (18)

返回列表

当前主题已经存档。

428616

应助: (幼儿园)
在线:
虫号: 797070

[交流] 【求助】请教一下在amber中的一个问题

Sample Text请教一下在amber中得到底物的top和par。如何将这两个文件与蛋白质的partop和inpcrd整合在一起，在amber里如何是程序识别底物 Sample TextSample Text

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 11:23 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

关于核磁制样已经有3人回复
郑州大学申博已经有6人回复

1楼 2009-11-10 17:50:52

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tiyang1987

木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2116.6
帖子: 1368
在线: 17.6小时
虫号: 851135
注册: 2009-09-18
专业: 碳素材料与超硬材料

不知道咋弄，帮楼主顶起

赞一下

回复此楼

2楼2009-11-10 19:45:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhuhongaaa

金虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 396.9
红花: 2
帖子: 607
在线: 23小时
虫号: 748787
注册: 2009-04-14
性别: GG
专业: 高分子物理与高分子物理化

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

路过，帮楼主顶起。可怜我不用amber！

赞一下(1人)

回复此楼

分子模拟的主页http://varmilion.tk/

3楼2009-11-10 20:07:35

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

z6242948

木虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 2468
红花: 1
帖子: 80
在线: 58.2小时
虫号: 517295
注册: 2008-03-03
专业: 理论和计算化学

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-27 10:58

不需要底物的top和par 如果底物中不包含非标准残基，那么把底物和蛋白构成的复合物的pdb直接导入leap中创建就行如果包含非标准残基那么就需要用到antechamber创建prep和frcmod文件导入leap中再导入复合物pdb创建即可

赞一下(11人)

回复此楼

4楼2009-11-27 10:41:35

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 428616 的主题更新

返回列表