24小时热门版块排行榜    

查看: 608  |  回复: 3
当前主题已经存档。

evoforever

铁虫 (小有名气)

[交流] 请问:如何去除total RNA中的钉子DNA?

由于要做RT-PCR,我们用Trizol提的细菌total RNA,但是分别用NEB, Promeg和TaKaRa的无RNAase的DNAase处理后,样品做普通PCR都能扩出阳性的条带来(负对照的水没有),说明DNA除不干净(但用总DNA做对照发现DNAase活性都还是很好的)。感觉头都大了。

据说细菌的total RNA确实很难除DNA,大家都有什么好的办法请给个建议。谢了先!!

[ Last edited by 350784478 on 2009-11-14 at 11:57 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+2,VIP+0): 11-10 17:13
一般都是加DNase处理DNA
你用DNase处理DNA以后处理了DNase没有啊?不处理的话cDNA就完了……
处理DNase可以用酚抽提法,麻烦,RNA回收率低。我们实验室用的就是E.Z.N.A. TM Total RNA Kit 效果还可以。那个试剂盒的说明书上说EDTA高温灭菌也可以,没玩过,不予评价

附上说明书
http://www.omegabiotek.com.cn/ok ... 071211144441109.pdf
可以用QQ找我……
2楼2009-11-10 16:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljwei_163

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 11-10 17:14
会不会跟你的引物有关系?
因为你的引物结合区在基因的表达区,所以会P出带来?
共同讨论下,呵呵
3楼2009-11-10 16:29:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

evoforever

铁虫 (小有名气)

没试过试剂盒,估计不行了可以尝试一下下。

我们是用无RNAase的DNAase处理,加热失活DNAase后,先用普通PCR跑一遍,看看里面会否有DNA污染(这样做会有问题吗?)。如果只有mRNA而没合成第一链cDNA,从道理上说用ORF设计的引物应该不会有PCR阳性扩增结果吧?

正式的实验里负对照当然用的是不加RT酶的total RNA。
4楼2009-11-10 17:39:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 evoforever 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +3 启萌科技 2026-08-12 11/550 2026-08-13 22:57 by 启萌科技
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 28/1400 2026-08-13 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +4 majunge000 2026-08-11 6/300 2026-08-13 16:50 by 四季常青藤
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见