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germ2010

木虫 (正式写手)

Sustainability

[交流] 关于处理的重复问题

最近很困惑,求解!
    试验设计采用的是随机区组设计,设计了3个重复,取样的时候是分开取的,提DNA也是分开提的,现在需要定量PCR,发现如果每个DNA只做一管误差太大,每个DNA都做3次重复,成本太高了,时间也多很多!现在想请教高手,能不能把重复间的DNA混合,然后用混匀后的DNA做3个重复?
     小弟做的是土壤微生物,在纯培养的过程中也有同样的困惑,烦恼中,请大家帮忙!
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路虽遥行则必至!事虽难做则有成!努力奋斗!
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子

★ ★ ★ ★
amisking(金币+1,VIP+0): 11-6 17:43
germ2010(金币+3,VIP+0):多谢 11-15 21:34
我认为不能,如果混合了做三次RT-PCR得到的结果对比只能说明你仪器的好坏,或者你加样的水平。 你设置重复本来就是为了观测你样品的中某DNA含量是否平均,现在混合了,还怎么说明问题呢?
可以用QQ找我……
2楼2009-11-06 16:26:22
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germ2010

木虫 (正式写手)

Sustainability

引用回帖:
Originally posted by 红多多 at 2009-11-6 16:26:
我认为不能,如果混合了做三次RT-PCR得到的结果对比只能说明你仪器的好坏,或者你加样的水平。 你设置重复本来就是为了观测你样品的中某DNA含量是否平均,现在混合了,还怎么说明问题呢?

非常感谢您的指教,实际上要证明仪器的好坏和加样的水平不用混合也完全可以证明,关键是重复间的差异太大了,重复间的差异有时候比处理间还大多了,我的目的是比较不同处理间基因拷贝数的差异。
路虽遥行则必至!事虽难做则有成!努力奋斗!
3楼2009-11-06 17:09:36
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nsa0804

木虫 (正式写手)

★ ★
germ2010(金币+2,VIP+0):谢谢 11-15 21:34
不行的~~~ 这样你的区组间重复就没有意义了
努力使自己改变这世上唯一不变的就是变
4楼2009-11-06 17:13:08
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cato8163

银虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
amisking(金币+1,VIP+0): 11-6 17:43
germ2010(金币+3,VIP+0):非常感谢您的指教,谢谢 11-15 21:35
小可,最近也想做PR-PCR,针对你的情况,小可认为不可取。有些时候,确实处理间差异比重复间还大。在重复时,设计最少3个。最好是4个了,如果有1个偏差太大,是可以舍去的。虽然成本高了,但实验结果是可信的。
和老板说说,多做几个重复吧。 祝好运。
5楼2009-11-06 17:14:47
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germ2010

木虫 (正式写手)

Sustainability

引用回帖:
Originally posted by nsa0804 at 2009-11-6 17:13:
不行的~~~ 这样你的区组间重复就没有意义了

谢谢您的指教,有时候看外文文献也有人混合的,并且影响因子还比较高,
但是我讲不出混合有什么依据,
如果不混,工作量好大,结果太差还不能进行分析处理,郁闷中............要毕业啊,惨
路虽遥行则必至!事虽难做则有成!努力奋斗!
6楼2009-11-06 17:18:07
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germ2010

木虫 (正式写手)

Sustainability

引用回帖:
Originally posted by cato8163 at 2009-11-6 17:14:
小可,最近也想做PR-PCR,针对你的情况,小可认为不可取。有些时候,确实处理间差异比重复间还大。在重复时,设计最少3个。最好是4个了,如果有1个偏差太大,是可以舍去的。虽然成本高了,但实验结果是可信的。
...

谢谢您的指教,最好当然是不混合,但是,要毕业啊,要数据啊,郁闷..........
路虽遥行则必至!事虽难做则有成!努力奋斗!
7楼2009-11-06 17:21:33
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