应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】做静电势时格点的选取
51/1返回列表
查看: 379  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】做静电势时格点的选取

在做静电势时，gaussian中选取格点时，好像是规则有对称性的选取格点。我现在需要：对优化好的分子建立3维网格。The grid is calculated for 2500 points per atom,sampled randomly from 0 to a maximum distance of 8 Å from any atom.
这样建立格点不知道怎样建立？如果无法手动输入，怎样改gaussian代码？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2009-11-06 10:18:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuy069

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2009-11-6 11:17:
当在#行用关键词cube=(potential,cards)时，3维网格点是可以自取的。
包含分别指定每边的格点数、3维网格起始原点和分别指定每边点的间隔。可根据你的需要设计、选取。
具体操作、语法，相关手册都有讲解和示例 ...

这些我都看过，但好像与我问的不一样吧。
用cube=(potential,cards)，这个很依赖与坐标，如果用z坐标，笛卡尔坐标等，取不同坐标，用cube=(potential,cards)，用各自坐标算出的静电势都不相同。如果每个原子取2500个格点，任意取得距离为8埃时；这样选取格点时就不会依赖于坐标，这种方法叫CHELP-BOW方法。
赞一下 回复此楼
4楼2009-11-06 12:21:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

zlding

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-6 11:41
wuy069(金币+1,VIP+0): 11-6 12:22
命令行加cube=(potential,cards)
分子坐标后空行
a.cube               输出文件名称(可要可不要)
IFlag, X0, Y0, Z0 输出单元编号和网格原点。
N1, X1, Y1, Z1    X-方向的点数和点的间隔。
N2, X2, Y2, Z2    Y-方向的点数和点的间隔。
N3, X3, Y3, Z3    Z-方向的点数和点的间隔。
这个在zhou的教程中也有详细的说明的，本版就可以下载到
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2009-11-06 10:59:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3,VIP+0): 11-6 11:41
wuy069(金币+2,VIP+0): 11-6 12:22
wuy069(金币+2,VIP+0): 11-13 15:29
当在#行用关键词cube=(potential,cards)时，3维网格点是可以自取的。
包含分别指定每边的格点数、3维网格起始原点和分别指定每边点的间隔。可根据你的需要设计、选取。
具体操作、语法，相关手册都有讲解和示例，本论坛也多次讨论过。
最近还有在cubegen对话中如何自己选取、输入3维网格点的。
赞一下(11人) 回复此楼
3楼2009-11-06 11:17:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭