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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】做静电势时格点的选取

在做静电势时,gaussian中选取格点时,好像是规则有对称性的选取格点。我现在需要:对优化好的分子建立3维网格。The grid is calculated for 2500 points per atom,sampled randomly from 0 to a maximum distance of 8 Å from any atom.
这样建立格点不知道怎样建立?如果无法手动输入,怎样改gaussian代码?
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2009-11-6 11:17:
当在#行用关键词cube=(potential,cards)时,3维网格点是可以自取的。
包含分别指定每边的格点数、3维网格起始原点和分别指定每边点的间隔。可根据你的需要设计、选取。
具体操作、语法,相关手册都有讲解和示例 ...

这些我都看过,但好像与我问的不一样吧。
用cube=(potential,cards),这个很依赖与坐标,如果用z坐标,笛卡尔坐标等,取不同坐标,用cube=(potential,cards),用各自坐标算出的静电势都不相同。如果每个原子取2500个格点,任意取得距离为8埃时;这样选取格点时就不会依赖于坐标,这种方法叫CHELP-BOW方法。
4楼2009-11-06 12:21:01
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