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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】做静电势时格点的选取
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】做静电势时格点的选取

在做静电势时，gaussian中选取格点时，好像是规则有对称性的选取格点。我现在需要：对优化好的分子建立3维网格。The grid is calculated for 2500 points per atom,sampled randomly from 0 to a maximum distance of 8 Å from any atom.
这样建立格点不知道怎样建立？如果无法手动输入，怎样改gaussian代码？
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1楼 2009-11-06 10:18:06
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zlding

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-6 11:41
wuy069(金币+1,VIP+0): 11-6 12:22
命令行加cube=(potential,cards)
分子坐标后空行
a.cube               输出文件名称(可要可不要)
IFlag, X0, Y0, Z0 输出单元编号和网格原点。
N1, X1, Y1, Z1    X-方向的点数和点的间隔。
N2, X2, Y2, Z2    Y-方向的点数和点的间隔。
N3, X3, Y3, Z3    Z-方向的点数和点的间隔。
这个在zhou的教程中也有详细的说明的，本版就可以下载到
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2楼2009-11-06 10:59:00
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zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3,VIP+0): 11-6 11:41
wuy069(金币+2,VIP+0): 11-6 12:22
wuy069(金币+2,VIP+0): 11-13 15:29
当在#行用关键词cube=(potential,cards)时，3维网格点是可以自取的。
包含分别指定每边的格点数、3维网格起始原点和分别指定每边点的间隔。可根据你的需要设计、选取。
具体操作、语法，相关手册都有讲解和示例，本论坛也多次讨论过。
最近还有在cubegen对话中如何自己选取、输入3维网格点的。
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3楼2009-11-06 11:17:22
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2009-11-6 11:17:
当在#行用关键词cube=(potential,cards)时，3维网格点是可以自取的。
包含分别指定每边的格点数、3维网格起始原点和分别指定每边点的间隔。可根据你的需要设计、选取。
具体操作、语法，相关手册都有讲解和示例 ...

这些我都看过，但好像与我问的不一样吧。
用cube=(potential,cards)，这个很依赖与坐标，如果用z坐标，笛卡尔坐标等，取不同坐标，用cube=(potential,cards)，用各自坐标算出的静电势都不相同。如果每个原子取2500个格点，任意取得距离为8埃时；这样选取格点时就不会依赖于坐标，这种方法叫CHELP-BOW方法。
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4楼2009-11-06 12:21:01
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