24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 714  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zier1011

木虫 (著名写手)

[交流] PCR法检测微生物

问下下,通过PCR检测微生物16sRNA的方法,能不能检测到种呢?原理就是检测碱基含量吗?会不会有微生物的16sRNA的碱基含量相似,跑胶看不出来呢?
鄙人对这一块知道甚少,希望大家踊跃发言

看了大家的回复,追加如下问题:
诸位,谢谢大家的回复
鄙人并不是要确定所得菌株是否新种,而是想了解一下,通过鉴定16sRNA的碱基比例,能否检测微生物种的不同?
即使只能到属,也可以,关键是这种方法是否可行?这种原理有没有科学根据?

[ Last edited by zier1011 on 2009-11-10 at 15:06 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

花还香香的
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biocontrol

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
个人觉的,16s 还不能到种,一般来说,如果在GENBANK上相似在95以上,说明你不是新种,不是新种,就没有什么重大意义。没有必要再定到种了。
如果相似率低,说明可能是新种。如果有价值可以测生理生化指标,主要脂肪酸之类的,然后就可以定种了。楼上说的IGS和ITS都是对真菌而言。
裸奔进行时...
8楼2009-11-10 06:11:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

fykxy_206

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+3,VIP+0):很详细 谢谢 11-5 19:47
PCR检测微生物的16S应该精确不到种,只能在属种,就是你检测的菌株大概是什么属。要精确到种的话还要做相应的生理生化实验。检测的原理不是你所说的检测碱基的含量,而是检测16SRNA的碱基的序列,就是你PCR后送去测序,结果在NCBI中的BLAST比对,从而确定是什么属。
2楼2009-11-05 16:43:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by fykxy_206 at 2009-11-5 16:43:
PCR检测微生物的16S应该精确不到种,只能在属种,就是你检测的菌株大概是什么属。要精确到种的话还要做相应的生理生化实验。检测的原理不是你所说的检测碱基的含量,而是检测16SRNA的碱基的序列,就是你PCR后送去 ...

有的文献上也说过当16SRNA相似程度大于98%时可以认为是同种。
3楼2009-11-05 23:29:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fykxy_206

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zhuifeng7000 at 2009-11-5 23:29:

有的文献上也说过当16SRNA相似程度大于98%时可以认为是同种。

有吗?我们老师没有这样说,我们99%都不敢说是同种呢。
4楼2009-11-06 09:41:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 恳请有学校收留 +3 柯淮然 2026-04-12 3/150 2026-04-14 16:25 by 逆水乘风
[考研] 药学305求调剂 +10 玛卡巴卡boom 2026-04-10 10/500 2026-04-14 15:55 by zs92450
[考研] 279求调剂 +12 张番茄不炒蛋 2026-04-11 12/600 2026-04-14 15:38 by zs92450
[考研] 271求调剂 +35 2261744733 2026-04-11 41/2050 2026-04-14 15:36 by zs92450
[考研] 297求调剂 +23 ORCHID1 2026-04-10 26/1300 2026-04-14 13:52 by 陈皮皮
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +18 振—TZ 2026-04-10 19/950 2026-04-14 10:34 by screening
[考研] 调剂求收留 +32 果然有我 2026-04-10 33/1650 2026-04-14 08:49 by 木木mumu~
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 冬日阳光CAS 2026-04-09 6/300 2026-04-13 18:40 by liuchb715
[考研] 材料复试求调剂 +24 xhhdjdjsjks 2026-04-09 24/1200 2026-04-13 15:49 by 幸免 ..
[考研] +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 296求调剂 +14 汪!?! 2026-04-10 16/800 2026-04-12 10:48 by zhouyuwinner
[考研] 280求调剂 +13 wzzz王 2026-04-09 13/650 2026-04-12 00:31 by 勇攀高峰0126
[考研] 085400 328分 求调剂 +10 喂你一个大橙子 2026-04-09 14/700 2026-04-11 19:53 by lqspecial
[考研] 085501机械专硕 302分 不挑专业求调剂 +7 汪某. 2026-04-09 7/350 2026-04-11 14:37 by luhong1990
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 一志愿东北大学控制工程085406数二英二385,求调剂 +8 Ezra_Zhang 2026-04-09 8/400 2026-04-11 09:15 by 猪会飞
[考研] 309求调剂 +14 wdhw 2026-04-10 15/750 2026-04-10 21:06 by zhouxiaoyu
[考研] 070300化学 求调剂 +13 73372112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 20:22 by maddjdld
[考研] 材料专硕初试分332一志愿西北工业大学, +12 故人?? 2026-04-09 12/600 2026-04-09 18:34 by Ccclqqq
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +8 bradoner 2026-04-08 9/450 2026-04-09 13:43 by only周
信息提示
请填处理意见