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faqianliu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于TD-DFT计算紫外光谱及采用分子轨道进行解释的几个问题

关于TD-DFT计算紫外光谱及采用分子轨道进行解释的几个问题,请高手指正:

部分问题选自Adv. Mater. 2008, 20, 1870–1875
论文解析了三个晶体的结构,以TD-DFT结论来解释紫外光谱信息,从而解释材料的三阶非线性。

以配合物1为例,其结构参见附件图1


附件图2为其紫外光谱曲线以及分子轨道解释
两条紫外光谱曲线分别为配合物1的实验值和使用gaussian03 TD-DFT计算的理论值

其中论文中peak1的量子化学解释为HOMO-2到LUMO的跃迁,并指出为(3ps至5dw的跃迁)

提供了部分TD-DFT结果,并给出了相应轨道的轨道系数,参见附图3


现有几个疑问请教各位:
问题1:根据excited state 8 的结果,peak1应为四种跃迁的组合,为何论文中只认定是101-104的跃迁,是不是因为101-104的跃迁系数最大?

问题2:判定为101-104跃迁后,根据后面的轨道系数,如何判定为3ps至5dw的跃迁?从101-104的轨道系数好像看不出S的3P轨道和W的5d轨道的特殊之处,是不是通过图形看的?

问题3:论文中计算的紫外光谱均处于500-200nm之间,为什么我采用TD-DFT计算的光谱范围为4000以下,其中有2XXXnm的,也有1XXXnm的,利用nstate=20才计算到500nm左右,利用nstate=50计算到300nm左右,汗死,我看该论文提供的第一激发态就处于500nm以下,能不能加入某些参数使gaussian只计算500-200nm之间的紫外光谱?

问题4:论文中称该计算是在DMF溶剂中进行,并给出了DMF的介电常数为36.7,但是如何在输入文件中体现,应该是scrf=(solvent=dmf 36.7)?请高手指正?最好给出命令行,非常感谢!

问题5:我计算的体系为开壳层多金属配合物体系,除避免在解释时使用HOMO及LUMO轨道外,在计算时有没有特别需要注意的问题?我计算的体系自旋多重度为2,计算结果如下:
Excited State   1:   ?Spin  -A      0.2640 eV 4695.86 nm  f=0.0000
    100B ->105B       -0.10199
    100B ->106B       -0.21311
    100B ->107B        0.80119
    100B ->108B        1.05220
    101B ->107B       -0.17708
    101B ->108B       -0.23320
其中所有的激发态为什么会出现问号?


本人为做晶体的,对量子化学不懂,刚接触gaussian半个月左右,看了论坛很多资料,这几个问题也无法解释,还请各位高手不要见笑,再谢!

[ Last edited by faqianliu on 2009-11-2 at 13:28 ]
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faqianliu

银虫 (小有名气)

lei0736(金币+0,VIP+0):还是看不到 居然放在QQ空间 11-2 11:38
终于把图片搞定了,哪位高手给指导一下

[ Last edited by faqianliu on 2009-11-2 at 11:23 ]
2楼2009-11-02 11:12:13
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liuxiaocunde

铁杆木虫 (著名写手)

古德里安将军

图片看不到
显示是:
此图片来自QQ空间
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新征途
3楼2009-11-02 12:39:47
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faqianliu

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by liuxiaocunde at 2009-11-2 12:39:
图片看不到
显示是:
此图片来自QQ空间
未经允许不准使用

重新整理了一下

[ Last edited by faqianliu on 2009-11-2 at 13:28 ]
4楼2009-11-02 13:07:39
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

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yjcmwgk(金币+5,VIP+0): 11-2 14:34
问题1:根据excited state 8 的结果,peak1应为四种跃迁的组合,为何论文中只认定是101-104的跃迁,是不是因为101-104的跃迁系数最大?
是,且平方以后相对更大。

问题2:判定为101-104跃迁后,根据后面的轨道系数,如何判定为3ps至5dw的跃迁?从101-104的轨道系数好像看不出S的3P轨道和W的5d轨道的特殊之处,是不是通过图形看的?
有经验者从轨道系数就可以看出来,当然从图形看更简单直接。

问题3:论文中计算的紫外光谱均处于500-200nm之间,为什么我采用TD-DFT计算的光谱范围为4000以下,其中有2XXXnm的,也有1XXXnm的,利用nstate=20才计算到500nm左右,利用nstate=50计算到300nm左右,汗死,我看该论文提供的第一激发态就处于500nm以下,能不能加入某些参数使gaussian只计算500-200nm之间的紫外光谱?
你的体系算出来是多少就是多少。至于有没有参数“使gaussian只计算500-200nm之间的紫外光谱”,同求……不过我没找到过。

问题4:论文中称该计算是在DMF溶剂中进行,并给出了DMF的介电常数为36.7,但是如何在输入文件中体现,应该是scrf=(solvent=dmf 36.7)?请高手指正?最好给出命令行,非常感谢!
命令行看说明书scrf一节。但该文献用的哪种溶剂模型应有具体说明,或许在supporting里面。

问题5:我计算的体系为开壳层多金属配合物体系,除避免在解释时使用HOMO及LUMO轨道外,在计算时有没有特别需要注意的问题?我计算的体系自旋多重度为2,计算结果如下:
Excited State   1:   ?Spin  -A      0.2640 eV 4695.86 nm  f=0.0000
    100B ->105B       -0.10199
    100B ->106B       -0.21311
    100B ->107B        0.80119
    100B ->108B        1.05220
    101B ->107B       -0.17708
    101B ->108B       -0.23320
其中所有的激发态为什么会出现问号?
开壳层体系我见过多种说法,有说gaussian的td不能正确处理的,有说应该选用RO基态波函数的,有说无影响的。我倾向于RO方法,但无论如何gaussian的td方法是不适于处理开壳层体系的,推荐软件orca、nwchem等。也有人说可以用一个闭壳层的激发态代替开壳层作为参考态进行td计算,具体怎么做、结果如何我不清楚。
问号是因为基态为开壳层时软件辨别不了激发后的自旋态。

[ Last edited by Jasminer on 2009-11-2 at 14:19 ]
5楼2009-11-02 13:44:05
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faqianliu

银虫 (小有名气)

谢楼上回答,

问题2 中101-104跃迁,指定为S的3P轨道,可我从轨道系数看,对于4S,和6S, 其中3PX,3PY,3PZ,和4PX,4PY,4PZ没有什么区别,那如何指定为3P呢?另,W原子的5d轨道是从哪一行系数看出来的,量子化学不懂,请指教,谢谢!

问题5中,RO方法应该采用哪个关键词,最近一直研究TD,汗
6楼2009-11-02 13:52:09
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

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yjcmwgk(金币+3,VIP+0): 11-2 14:34
问题2 中101-104跃迁,指定为S的3P轨道,可我从轨道系数看,对于4S,和6S, 其中3PX,3PY,3PZ,和4PX,4PY,4PZ没有什么区别,那如何指定为3P呢?另,W原子的5d轨道是从哪一行系数看出来的,量子化学不懂,请指教,谢谢!
3px……4pz等都对应于3p轨道,同理,w的7d?……8d?都对应于5d轨道。具体说太麻烦,你自己可以搜一些关于基函与轨道关系的资料看一看。

问题5中,RO方法应该采用哪个关键词,最近一直研究TD,汗
上一贴编辑过,你再看看。ro是加在理论级别如hf前的前缀,表示限制性开壳层。
7楼2009-11-02 14:14:19
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faqianliu

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by Jasminer at 2009-11-2 14:14:
问题2 中101-104跃迁,指定为S的3P轨道,可我从轨道系数看,对于4S,和6S, 其中3PX,3PY,3PZ,和4PX,4PY,4PZ没有什么区别,那如何指定为3P呢?另,W原子的5d轨道是从哪一行系数看出来的,量子化学不懂,请指教,谢谢 ...

谢楼上解释:
问题2是最近一直困扰我的问题,多谢指导,图解量子化学这本书是不是有相关的资料,下载了这本书一直没看,基础太差,或者是其它的书籍有相关资料?

问题5:是不是采用如rob3lyp/lanl2mb这样的算法,多谢
8楼2009-11-02 14:25:01
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-2 18:37
问题2是最近一直困扰我的问题,多谢指导,图解量子化学这本书是不是有相关的资料,下载了这本书一直没看,基础太差,或者是其它的书籍有相关资料?
我记得郭勇的《高斯使用指南》里有相应的讨论。

问题5:是不是采用如rob3lyp/lanl2mb这样的算法,多谢
9楼2009-11-02 14:51:06
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faqianliu

银虫 (小有名气)

多谢Jasminer的耐心指导,非常非常感谢!
10楼2009-11-02 15:05:15
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